ההבדל העיקרי בין סיום עצמאי תלוי Rho ו-Rho הוא שבסיום תלוי Rho, גורם Rho נקשר לתמלול ומסיים את התמלול על ידי שבירת קשרי מימן בין התבנית לתמלול, בעוד שסיום עצמאי של Rho מסיים את התמלול על ידי ייצור מבנה לולאת סיכת ראש ולאחר מכן אזור U עשיר בתמליל.
תעתוק הוא אחד משני השלבים של ביטוי גנים. זהו התהליך שמייצר רצף mRNA מהמידע הגנטי החבוי ברצף ה-DNA של הגן. התמלול מתבצע באמצעות שלושה שלבים: התחלה, התארכות וסיום.אנזים RNA פולימראז נקשר לרצף המקדם של הגן ומתחיל לזרז את הסינתזה של גדיל ה-RNA. עד שיימצא רצף המחסל, RNA פולימראז מוסיף נוקלאוטידים ובונה את גדיל ה-RNA. בפרוקריוטים, הסיום מתרחש באמצעות שתי אסטרטגיות סיום עיקריות: סיום תלוי Rho וסיום עצמאי של Rho. Rho factor הוא חלבון בעל פעילות הליקאזית.
מהו סיום תלויי רו?
סיום תלוי ב-Rho הוא אחד משני הסוגים של אסטרטגיית סיום תעתיק המתרחשת בפרוקריוטים. Rho factor הוא חלבון בעל פעילות הליקאזית.
איור 01: סיום תלויי רו
חלבון Rho נקשר עם תמליל ה-RNA ונע לאורך פולימראז ה-RNA בכיוון 5'-3', מעודד את הניתוק של קשרי מימן בין תבנית ה-DNA לתעתיק ה-RNA.כאשר גורם Rho מגיע לבועת התעתיק, הוא מרחיק את ה-DNA/RNA היברידית ומשחררת את התמלול מבועת התעתיק. כאשר זה קורה, זה מסיים את התמלול.
מהו סיום עצמאי של רו?
סיום עצמאי של רו היא האסטרטגיה השנייה שמסיימת את השעתוק הפרוקריוטי. בדרך כלל, לאזור סיום יש רצף חוזר הפוך. מיד לאחר רצף החוזר ההפוך, ישנו אזור עשיר באדנין (AAAA). כאשר RNA פולימראז מתקדם, הוא מייצר רצף mRNA. מכיוון ששני האזורים משלימים באזור הרצף החוזר ההפוך, הוא יוצר מבנה לולאת סיכת ראש עקב קישור מימן. האזור הבא יהיה האזור העשיר ב-U. מבנה סיכת שיער מפסיק את פעילות ה-RNA פולימראז.
איור 02: Rho Independent Termination
יתרה מכך, באזורים העשירים ב-U, יש אינטראקציות חלשות בין בסיסי U של תמליל ובסיסי A של התבנית. קשרים חלשים אלו של אדנין-אורציל מערערים את תבנית ה-DNA ואת תמליל ה-RNA ומפרידים זה את זה. בסופו של דבר, התמליל משחרר מאתר התמלול.
מהם הדמיון בין Rho Dependent ל-Rho Independent Termination?
- סיום תלוי ב-Rho ו-Rho עצמאי הן שתי אסטרטגיות סיום עיקריות שנמצאות בפרוקריוטים.
- שני הטפסים משחררים תמליל מתבנית ה-DNA כדי לסיים את התמלול.
מה ההבדל בין Rho Dependent ל-Rho Independent Termination?
סיום התלוי ב-Rho מתווך על ידי חלבון Rho בעוד שסיום עצמאי של Rho מתרחש באמצעות היווצרות של מבנה לולאת סיכת ראש.אז זה ההבדל העיקרי בין סיום עצמאי של Rho לבין סיום עצמאי של Rho. יתר על כן, חלבון Rho מנצל אנרגיית ATP בעוד שסיום עצמאי של Rho אינו כרוך בחלבון Rho ואינו מנצל אנרגיית ATP. לכן, זהו גם הבדל משמעותי בין סיום עצמאי של Rho ו-Rho עצמאי.
האינפוגרפיקה שלמטה מציגה השוואות נוספות הקשורות להבדל בין סיום עצמאי של Rho ו-Rho.
סיכום – Rho Dependent vs Rho Independent Termination
סיום תלוי-Rho ו-Rho עצמאי הם שני מנגנוני סיום התעתוק העיקריים המתרחשים בפרוקריוטים. חלבון Rho אחראי להפסקת השעתוק בסיום תלוי Rho.לעומת זאת, סיום עצמאי של Rho מתרחש באמצעות היווצרות של מבנה לולאת סיכת השיער. אז זה ההבדל העיקרי בין סיום עצמאי של Rho ל-Rho עצמאי.
