פפטיד לעומת חלבון
חומצות אמינו, פפטידים וחלבונים מכונים לעתים קרובות כמונחים קשורים, אך הם שונים במאפיינים שלהם. חומצות אמינו הן אבני הבניין של פפטידים וחלבונים כאחד. חומצת אמינו היא מולקולה קטנה המכילה קבוצת אמינו (-NH2) וקבוצת חומצה קרבוקסילית (-COOH), הקשורות לאטום פחמן מרכזי, עם מימן נוסף ו שרשרת צדדית (קבוצת R). שרשרת צד זו משתנה בין כל חומצות האמינו; לפיכך הוא קובע את הדמויות הייחודיות ואת הכימיה של כל חומצת אמינו. רצף גנים מסוים משמש לקביעת רצף חומצות האמינו הן בפפטידים והן בחלבונים.
Peptide
פפטידים מורכבים משתי חומצות אמינו או יותר, מקושרות בקשרי פפטידים ונמצאים כשרשראות ליניאריות. אורכו של פפטיד נקבע לפי כמות חומצות האמינו שבו. בדרך כלל אורכו של פפטיד קטן מ-100 חומצות אמינו לערך.
קידומות משמשות לתיאור סוג הפפטידים בטרמינולוגיה כללית. לדוגמה, כאשר פפטיד עשוי משתי חומצות אמינו, הוא נקרא דיפפטיד. כך משולבים שלוש חומצות אמינו ליצירת טריפפטידים, ארבע חומצות אמינו משולבות ליצירת טטרפפטידים וכו'. מלבד הסוגים הללו, ישנם אוליגופפטידים (המורכבים מ-2-20 חומצות אמינו) ופוליפפטידים, שיש בהם פפטידים רבים (פחות מ-100). המאפיינים האופייניים החשובים ביותר של פפטידים נקבעים לפי הכמות ורצף חומצות האמינו.
התפקיד העיקרי של רוב הפפטידים הוא לאפשר תקשורת יעילה על ידי העברת מסרים ביוכימיים ממקום אחד למשנהו בגוף.
Protein
חלבונים הם הקבוצה המגוונת ביותר של מקרומולקולות ביולוגיות. חלבון מורכב משרשרת אחת או יותר ארוכות לא מסועפות הנקראות פוליפפטידים ובכל זאת אבני הבניין של חלבונים הן חומצות אמינו. רצף חומצות האמינו קובע את המאפיינים העיקריים של חלבון, בעוד רצף חומצות אמינו זה מוגדר על ידי רצף הגנים המסוים.
לרוב לחלבונים יש מבנים תלת מימדיים יציבים. ניתן לדון במבנים אלו במונחים של היררכיה של ארבע רמות; ראשוני, שניוני, שלישוני ורבעוני. המבנה הראשוני הוא רצף חומצות האמינו של חלבון. המבנה המשני מיוצר על ידי יצירת קשרי מימן בין שתי חומצות אמינו סמוכות, וכך נוצרים מבנים הנקראים יריעות מצופה β, וסלילים הנקראים α-helices. אזורי המבנה המשני מתקפלים לאחר מכן בחלל כדי ליצור את המבנים התלת מימדיים הסופיים של החלבון. סידור הפוליפפטידים המרובים בחלל מביא למבנה הרבעוני של חלבון.
הפונקציות העיקריות של חלבונים הם קטליזה של אנזים, הגנה, הובלה, תמיכה, תנועה, ויסות ואחסון.
מה ההבדל בין פפטיד לחלבון?
• פפטידים הם שרשראות ליניאריות קצרות של חומצות אמינו, בעוד שחלבונים הם שרשראות ארוכות מאוד של חומצות אמינו.
• מספר חומצות אמינו מקושרות יחד ליצירת פפטיד על ידי קשרים פפטידים, בעוד שמספר פפטידים מקושרים יחד ליצירת מולקולות חלבון.
• בדרך כלל, לחלבונים יש מבנים תלת מימדיים יציבים. לעומת זאת, פפטידים אינם מאורגנים במבנה תלת מימדי יציב.
• אורך של פפטיד הוא פחות מ-100 חומצות אמינו בקירוב, בעוד של חלבון הוא יותר מ-100 חומצות אמינו. (יש יוצאים מן הכלל; לפיכך, ההבדלים מסתמכים יותר על תפקוד המולקולות, ולא על הגדלים שלהן)
• בניגוד לפפטידים, חלבונים נחשבים כמקרומולקולות.
• בפפטידים, רק שרשראות צד של חומצות אמינו יוצרות קשרי מימן. ואילו בחלבונים, לא רק שרשראות צד, אלא גם קבוצות פפטידים, יוצרות קשרי מימן. קשרי מימן אלו יכולים להיות עם מים או עם קבוצות פפטידים אחרות.
• כל הפפטידים קיימים כשרשראות ליניאריות בעוד שחלבונים יכולים להתקיים כראשוניים, משניים, שלישוניים ורבעוניים.
