ההבדל העיקרי בין גורם סיגמא לגורם rho הוא שגורם סיגמא הוא חלבון הדרוש לתחילת השעתוק בחיידקים בעוד שגורם rho הוא חלבון הדרוש להפסקת השעתוק בחיידקים.
Sigma factor ו-rho factor הם שני גורמים חשובים לשעתוק חיידקים. שעתוק חיידקי הוא תהליך שבו חתיכת DNA חיידקי מועתקת לגדיל חדש של mRNA (RNA שליח). תהליך זה מזורז על ידי אנזים המכונה RNA פולימראז. חיידקים מסתמכים במידה רבה על תמלול ותרגום על מנת להגיב כראוי לסביבתם.ה-RNA פולימראז החיידקי מורכב מליבה ומבנה הולואנזים. הליבה מכילה את תת-היחידות β, β′, α ו-2ω בעוד שההולואנזים מכיל את גורם הסיגמא. יתרה מכך, גורם נלווה ל-RNA פולימראז הידוע כגורם rho חשוב מאוד גם לשעתוק חיידקים.
מהו סיגמא פקטור?
סיגמא פקטור או גורם ספציפי הוא חלבון הדרוש לתחילת השעתוק בחיידקים. זהו גורם התחלת שעתוק חיידקי. גורם זה מאפשר את הקישור של אנזים RNA פולימראז לאזור ספציפי של ה-DNA הנקרא אזור הפרומוטור במהלך שעתוק. גורם סיגמא הוא בדרך כלל הומולוגי לגורם שעתוק ארכאי B ולגורם שעתוק אאוקריוטי TF11B. יתר על כן, גורם הסיגמא הספציפי של גן נתון משתנה בהתאם לגן ולאותות הסביבה. המקדמים נבחרים על ידי RNA פולימראז בהתאם לגורם הסיגמא הקשור אליו.
איור 01: Sigma Factor
את גורם הסיגמה ניתן למצוא גם בכלורופלסט של צמחים כחלק מהפולימראז המקודד לפלסטידים (PEP). גורם הסיגמא ו-RNA פולימראז בכלל ידועים כ-RNA polymerase holoenzyme. המשקל המולקולרי של גורם הסיגמא הוא בסביבות 70 kDa. לאחר התחלת התעתיק, גורם הסיגמא מתנתק מהקומפלקס. אז ה-RNA פולימראז ממשיך להתארך עד שהשעתוק מסתיים.
מהו Rho Factor?
Rho factor הוא חלבון פרוקריוטי המעורב בהפסקת השעתוק. Rho factor בדרך כלל נקשר לאתר ההפסקה של טרנסקריפציה. אתר זה הוא אזור חשוף של RNA חד-גדילי ליד מסגרת הקריאה הפתוחה ברצפים עניים בגואנין עשירים בציטוזין.זהו חלבון שעתוק חיוני בפרוקריוטים. ב-Escherichia coli, גורם rho הוא כ-274.6 kDa הקסאמר של תת-יחידות זהות. לכל תת-יחידה יש תחום מחייב RNA ותחום הידרוליזה של ATP. יתר על כן, תפקידו של גורם rho הוא פעילות הליקאזות.
איור 02: Rho Factor
Rho factor נקשר למולקולת RNA ולאחר מכן משתמש בפעילות ה-ATPase שלו כדי לספק אנרגיה להעברה של מולקולות RNA. גורם Rho מבצע טרנסלוקציה עד שהוא מגיע לאזור הסליל של RNA-DNA, שם הוא משחרר את מבנה הדופלקס ההיברידי (RNA-DNA). תהליך זה משהה את RNA פולימראז באתר הסיום ומסיים את תהליך השעתוק.
מהם הדמיון בין Sigma Factor ל-Rho Factor?
- Sigma factor ו-rho factor הם שני גורמים חשובים לשעתוק חיידקים.
- שניהם קיימים רק בפרוקריוטים.
- הם חלבונים המורכבים מחומצות אמינו.
- שניהם הם חלבונים קושרים חומצות גרעין.
- פרוקריוטים מסתמכים במידה רבה על גורמים אלה כדי ליצור mRNA שיכול ליצור חלבונים מוזרים ולעזור להם להגיב ספציפית לסביבתם.
מה ההבדל בין Sigma Factor ל-Rho Factor?
Sigma factor הוא חלבון הדרוש להתחלת שעתוק בחיידקים, בעוד rho factor הוא חלבון הדרוש להפסקת שעתוק בחיידקים. אז זה ההבדל העיקרי בין גורם סיגמא לגורם rho. יתר על כן, גורם הסיגמה הוא חלבון קושר DNA, בעוד שגורם rho הוא חלבון קושר ל-RNA.
האינפוגרפיקה שלהלן מציגה את ההבדלים בין גורם סיגמא לגורם rho בצורת טבלה להשוואה זו לצד זו.
סיכום – Sigma Factor נגד Rho Factor
תעתוק הוא התהליך שבו המידע ב-DNA מועתק למולקולה חדשה בשם mRNA (RNA שליח). m-RNA זה מעורב בסופו של דבר בייצור חלבון ספציפי. גורם סיגמא וגורם rho הם שני גורמים חשובים לשעתוק חיידקים. הם חלבונים. גורם סיגמא משתתף בהתחלת שעתוק בחיידקים. גורם Rho אחראי להפסקת השעתוק בחיידקים. לפיכך, זהו סיכום ההבדל בין גורם סיגמא לגורם rho.
