ההבדל העיקרי בין dATP ל-ddATP הוא ש-dATP אינו מסיים את סינתזת ה-DNA בעוד ש-ddATP מסוגל לסיים את סינתזת ה-DNA. הסיבה לכך היא של-ddATP יש אטום H המחובר למיקום 3ʹ של סוכר הפנטוז ואילו ל-dATP יש קבוצת OH המחוברת למיקום 3ʹ.
dNTPs הם אבני בניין של DNA. ישנם ארבעה סוגים של dNTP על פי בסיסי הפורין או הפירימידין-dATP אחד מהם. הבסיס החנקני של dATP הוא אדנוזין. ddNTPs הם נוקלאוטידים המשמשים ברצף Sanger. ישנם ארבעה סוגים של ddNTPs. ddATP הוא ddNTPs.
מה זה dATP?
Deoxyadenosine triphosphate הוא נוקלאוטיד, שהוא אבן בניין של DNA.אנזים DNA פולימראז משתמש ב-dATP כמצע לסינתזת DNA. ל-dATP שלושה מרכיבים: מולקולת סוכר דאוקסיריבוז, אדנוזין ושלוש קבוצות הפוספט. לכן, זהו טריפוספט נוקלאוזיד פורין. הנוסחה הכימית של dATP היא C10H16N5O12 P3, והמסה המולקולרית שלו היא 491.182.
איור 01: dATP
dATP שונה מ-ATP (אדנוזין טריפוספט) מבחינת רכיבי הסוכר. ל-ATP יש סוכר ריבוז. בסיס dATP מזדווג עם נוקלאוטיד uracil במהלך שעתוק. בנוסף להשתתפות בסינתזת DNA, dATP יכול לשמש כמולקולה מעבירה אנרגיה כדי לשמור גם על כדאיות התא. רמה גבוהה של dATP בגוף היא רעילה מכיוון שהיא יכולה לשמש מעכב לא תחרותי לאנזים ribonucleotide reductase.זה יכול להוביל לפגיעה בתפקוד החיסוני.
מה זה ddATP?
Dideoxyadenosine triphoaphate או ddATP הוא אחד מארבעת סוגי הנוקלאוטידים המשמשים בשיטת ריצוף Sanger. מבחינה מבנית, ל-ddATP יש גם שלושה רכיבים הדומים ל-dATP. הם בסיס אדנין, סוכר דאוקסיריבוז ושלושה פוספטים.
איור 02: ddATP
בניגוד ל-dATP, ל-ddATP חסרה קבוצת OH במיקום 3ʹ של סוכר הפנטוז על מנת ליצור קשר פוספודיסטר עם הנוקלאוטיד הסמוך ולהמשיך את התארכות השרשרת. יש לו אטום H במצב 3'. לכן, לאחר שילוב ddATP, סינתזת ה-DNA מסתיימת. זהו העיקרון הבסיסי של רצף Sanger. לכן, ddATP פועל כמעכב התארכות שרשרת ברצף Sanger. ישנם ארבעה צינורות בשימוש ברצף Sanger ו-ddATP מתווסף לשפופרת אחת.
מהם הדמיון בין dATP ל-ddATP?
- dATP ו-ddATP הם נוקלאוטידים.
- שניהם מורכבים מאדנין, דאוקסיריבוז ושלושה פוספטים.
- הם תרכובות אורגניות.
- גם dATP וגם ddATP מתווספים לצינורות ברצף של Sanger.
מה ההבדל בין dATP ל-ddATP?
dATP יש קבוצת OH במיקום 3ʹ של סוכר הפנטוז בעוד ל-ddATP חסרה קבוצת OH במיקום 3ʹ של סוכר הפנטוז. יתר על כן, dATP הוא מונומר המשמש בסינתזת DNA בעוד ש-ddATP משמש להפסקת התארכות השרשרת במהלך רצף Sanger. אז זה ההבדל העיקרי בין dATP ל-ddATP. יתרה מכך, dATP יכול ליצור קשרי פוספודיסטר בעוד ש-ddATP לא יכול ליצור קשרי פוספודיאסטר.
למטה אינפוגרפיקה מציגה הבדלים נוספים בין dATP ל-ddATP בצורת טבלה להשוואה זה לצד זה.
סיכום – dATP לעומת ddATP
בקיצור, dATP הוא מבשר לסינתזת DNA בעוד ש-ddATP הוא נוקלאוטיד המשמש להפסקת סינתזת ה-DNA ברצף Sanger. יתרה מכך, ל-dATP יש קבוצת OH במיקום 3' של סוכר פנטוז והוא מאפשר יצירת קשר פוספודיסטר עם הנוקלאוטיד הבא. בינתיים, ל-ddATP חסרה קבוצת OH במיקום 3'; לפיכך, הוא אינו מסוגל ליצור קשר פוספודיסטר עם הנוקלאוטיד הבא. כתוצאה מכך, רצף ה-DNA מפסיק את התארכותו. לפיכך, זה מסכם את ההבדל בין dATP ל-ddATP.