ההבדל העיקרי בין קונצנזוס PCR ל-Pan PCR הוא ש-PCR של קונצנזוס תמיד מכוון לאזורים שמורים בעוד Pan PCR מכוון לאזורים משתנים כדי לזהות זנים שונים של קבוצה
תגובת שרשרת פולימראז (PCR) היא טכניקת הגברה של גנים המורכבת משלושה שלבים עיקריים כמו דנטורציה, חישול והארכה. זה נמצא בשימוש נרחב באבחון וזיהוי מולקולרי. טכניקות קונצנזוס PCR ו-Pan PCR מבוססות על יעדי ה-primer שכל סוג PCR משתמש בהם.
מהו קונצנזוס PCR?
Consensus PCR היא טכניקת PCR המכוונת לאזור שמור עבור מין או סוג מסוים.לכן, אזורים שמורים מאוד נבחרים להגברה. באמצעות שיטה זו ניתן לזהות ולהבדיל בין אורגניזמים על סמך הקונצנזוס שלהם. שיטה זו מזהה אזור שמור עבור מין מסוים. לדוגמה, אזור 16s rRNA של חיידקים נשאר אזור שמור בין חיידקים. לכן, רק סט פריימר אחד נדרש להגברה. ברוב המקרים, ניתן להשתמש בפריימר אוניברסלי ספציפי לאזור השמור.
איור 01: טכניקת PCR
על ידי ביצוע שיטת PCR קונצנזוס, ניתן להסיק אפיון מינים ויחסים אבולוציוניים. בהתבסס על יעילות ההגברה של האורגניזם המדגם המסוים, ניתן גם להסיק את הקונצנזוס של האורגניזם כלפי הקבוצה. יתר על כן, ביצוע PCR קונצנזוס חיוני במחקרים פילוגנטיים.הוא מאפשר זיהוי של מין ומפרש את הסטייה שהאורגניזם המסוים מוצג במונחים של האב הקדמון המשותף.
מה זה Pan PCR?
A Pan PCR הוא מצב ריבוי של PCR. בטכניקה זו, זנים שונים מוגברים באמצעות מטרות פריימר שונות. המטרות, לעומת זאת, יכולות להיות יעדים נפוצים עבור קבוצות הזנים. לפיכך, ב-Pan PCR, ניתן להשתמש ביותר משני ערכות פריימר בו-זמנית. זה יכול להתרחש בשיטת תגובה של צינור בודד או כשיטת תגובה מרובת צינורות. Pan PCR גוזל זמן רב יותר ומורכב יותר בהשוואה ל-PCR קונצנזוס. מסיבה זו, הפרשנות של תוצאות ה-PCR עשויה להיות מורכבת יותר גם ב-Pan PCR.
היישום העיקרי של Pan PCR הוא באבחון מולקולרי. זה מאפשר להבחין בין זנים שונים של מין על ידי הגברה של מטרה. Pan PCR היא טכניקה אידיאלית לזיהוי זנים שונים של מין בודד הגורמים למחלה. ברוב המקרים, האוטומציה של טכניקות Pan PCR עבור מצבים בריאותיים שונים חשובה מאוד והיא טכניקה אמינה ויעילה ביותר.
מהם הדמיון בין קונצנזוס PCR ל-Pan PCR?
- Consensus PCR ו-Pan PCR הם שני סוגים של טכניקות PCR.
- שני ההליכים פועלים לפי ההליך הכללי בן שלושת השלבים - דנטורציה, חישול והרחבה.
- הם משתמשים בפריימרים שהם ספציפיים ליעד.
- שתי התגובות מתרחשות במחזור תרמי.
- ניתן לבצע תגובות אלו אוטומטיות.
- שניהם יכולים לשמש באבחון מולקולרי וזיהוי; עם זאת, הדיוק משתנה.
- הליכים אלה דורשים אימות.
מה ההבדל בין קונצנזוס PCR ל-Pan PCR?
הן קונצנזוס והן פאן PCR עוקבות אחר אותו נוהל שגרתי. עם זאת, ההבדל העיקרי בין קונצנזוס PCR ל-Pan PCR מבוסס על יעדי הפריימר שבהם כל הליך משתמש. בעוד ש-PCR קונצנזוס תמיד מכוון לאזורים שמורים, Pan PCR מכוון לאזורים משתנים כדי לזהות זנים שונים של קבוצה.בשל הבדל זה, הפרוטוקולים לעיצוב פריימר, מספר ערכות הפריימר בשימוש והיישומים הספציפיים משתנים.
האינפוגרפיקה שלהלן מסכמת את ההבדל בין קונצנזוס PCR ל-Pan PCR.
סיכום - קונצנזוס PCR לעומת Pan PCR
PCR, שהוצג על ידי Mulli, ממלא תפקיד מהפכני חשוב ביישומי ביולוגיה מולקולרית. קונצנזוס ו-Pan PCR הם שני סוגים של PCR המבוססים על אזורי היעד שלהם. בעוד קונצנזוס PCR מכוון לאזורים שמורים, Pan PCR מכוון לאזורים משתנים וממלא תפקיד חשוב בזיהוי הזנים. בשל ההבדל הבסיסי הזה בין קונצנזוס PCR ל-Pan PCR, הפונקציות הספציפיות של כל סוג של PCR משתנות גם מניתוח פילוגנטי לאפיון מולקולרי ועד לאבחון מולקולרי.
