ההבדל העיקרי בין CDS ל-cDNA הוא ש-CDS או רצף קידוד הוא החלק של תמליל שמתורגם למעשה לחלבון בעוד שרצף cDNA הוא רצף DNA הנגזר מה-mRNA על ידי שעתוק הפוך.
גן הוא רצף נוקלאוטידים המקודד לחלבון. הוא מורכב מאזורים שונים כמו אזור פרומטור, אתר התחלת שעתוק, אקסונים, קודון התחלה, אינטרונים וקודון עצור. לכן, לגן יש גם רצפים מקודדים וגם לא. רצפי קידוד או CDS מתייחסים לאקסונים ולשני קודונים, שהם קודון התחלה וקודון עצור. זה הרצף שמתורגם למעשה לחלבון.לעומת זאת, cDNA הוא רצף DNA הנגזר מה-mRNA על ידי שעתוק הפוך.
מה זה CDS?
CDS או רצף קידוד הוא חלק מגן שמתורגם למעשה לחלבון. הוא מורכב מאקסונים ושני קודונים כקודון AUG וקודון עצור. שלא כמו cDNA, CDS אינו מכיל שני אזורים לא מתורגמים: 5' UTR ו-3 אינץ' UTR. יתר על כן, אינטרונים אינם כלולים ב-CDS.
איור 01: רצף קידוד
בהשוואה לגנום כולו ולפרט, רצפי הקידוד הם חלק קטן. רצף הקידוד מורכב מרצף הנוקלאוטידים הדרוש ליצירת רצף חומצות האמינו של החלבון.
מהו cDNA?
cDNA או DNA משלים הוא רצף DNA שנוצר מרצף mRNA. הוא מסונתז על ידי התהליך הנקרא שעתוק הפוך.האנזים ה-reverse transcriptase מזרז סינתזת cDNA, ורצף mRNA משמש כתבנית לסינתזת cDNA. בעיקרון, ניתן לחלץ ולטהר mRNA של תאים אוקריוטיים על מנת ליצור cDNA. לאחר בניית cDNA מ-mRNA, ניתן לשבט אותם לתוך תא חיידקי על מנת ליצור ספריות cDNA. ספריות cDNA חשובות לניתוח של אזורי קידוד, תפקודי גנים וביטוי של גנים וכו'.
איור 02: cDNA
בניגוד לרצף קידוד, cDNA מכיל שני UTRs, שהם 3' UTR ו-5' UTR. בדומה לרצף הקידוד, cDNA אינו מכיל אינטרונים.
מהם הדמיון בין CDS ל-cDNA?
- CDS ו-cDNA הם חומצות גרעין.
- הם עשויים מדאוקסיריבונוקלאוטידים.
- הן CDS והן CDNA אינם מכילים אינטרונים, שהם אזורים לא מקודדים.
- שניהם מכילים את הקוד הגנטי או המידע לייצור חלבון.
מה ההבדל בין CDS ל-cDNA?
CDS או רצף קידוד הוא החלק בגן שמתורגם למעשה לחלבון. מצד שני, רצף cDNA הוא רצף DNA הנגזר מה-mRNA על ידי שעתוק הפוך. אז זה ההבדל העיקרי בין CDS ל-cDNA. חוץ מזה, CDS מורכב מאקסונים ושני קודונים, שהם קודון התחלה וקודון עצור. לעומת זאת, cDNA מורכב מרצף ה-mRNA המלא ושני UTRs.
יתרה מכך, סינתזת cDNA נעשית באופן מלאכותי מ-mRNA על ידי שעתוק הפוך בעוד ש-CDS נמצאים ב-DNA הגנומי.
למטה אינפוגרפיקה מציגה השוואות נוספות כדי להבחין בהבדל בין CDS ל-cDNA.
סיכום – CDS לעומת cDNA
רצף קידוד ו-cDNA הם שני סוגים של רצפי נוקלאוטידים. רצף הקידוד נמצא בתוך גן בעוד cDNA מסונתז באופן מלאכותי. לרצף המקודד יש אקסונים ושני קודונים ואילו ל-cDNA יש רצף mRNA ושני UTRs. גם ל-CDS וגם ל-cDNA יש רק את רצפי הנוקלאוטידים שמתורגמים למעשה לחלבון. הם אינם מכילים אינטרונים. בניגוד ל-CDS, תהליך סינתזה של cDNA דורש אנזים הפוך טרנסקריפטאז. כמו כן, cDNA יכול להמיר לספריות cDNA. לפיכך, זה מסכם את ההבדל בין CDS ל-cDNA.
