ההבדל העיקרי בין Cosmid ל- Phagemid הוא בסוג הרצפים שהוא מכיל. קוסמיד מכיל אתר קוס ופלסמיד. לכן, זהו וקטור היברידי בעוד שפאגמיד הוא פלסמיד המכיל מקור F1 של שכפול של הפאג F1.
קוסמידים ופאגמידים משמשים למטרות שיבוט, במיוחד כדי לשבט שברים גדולים יותר של DNA. אלה נמצאים בשימוש נרחב במיוחד בשיבוט גנים האחראים לייצור חלבונים שונים. קוסמידים ופאגמידים משוכפלים לבד כפלסמידים או שהם נארזים לחלקיקים ויראליים ואז משוכפלים.
מהו קוסמיד?
קוסמיד, המכונה פלסמיד היברידי, כולל אתרי קוס המופקים מחלקיקי פאג' למבדה ופלסמיד.אתרי cos אלה הם קטעים ארוכים של DNA עם 200 זוגות בסיסים. לפיכך, יש להם קצוות מלוכדים או דביקים המאפשרים לפלסמיד להשתלב ב-DNA הנגיפי. לכן, אתרי cos חיוניים לאריזת ה-DNA.
יש שלושה אתרי cos;
- אתר cosN - מעורב בחיתוך גדיל ה-DNA על ידי פעילות terminase
- cosB אתר - עוסק בהחזקת ה-terminase.
- אתר cosQ – מעורב במניעת פירוק ה-DNA על ידי DNases.
איור 01: Cosmid
כמו כן, קוסמידים יכולים לשכפל DNA חד-גדילי או DNA דו-גדילי באמצעות מקור מתאים של שכפול. קוסמידים מכילים בדרך כלל גנים של עמידות לאנטיביוטיקה כסמנים לבחירה של טרנספורמנטים.לפיכך, השימוש בקוסמיד בתור וקטור יכול להקל על השיבוט, ועיכול האנזים ההגבלה של הווקטור יכול לחלץ את הפרגמנטים האלה.
מהו פאגמיד (Phasmid)?
Phagemid, המכונה גם Phasmid, הוא גם סוג של וקטור היברידי. Phagemid מכיל מקור מיוחד של שכפול המכונה מקור f1 של שכפול. מקור f1 של שכפול מופק מפאג' f1.
Phagemid יכול לשכפל גם DNA חד-גדילי וגם דו-גדילי. שכפול יכול להתרחש כפלסמיד תוך כדי שכפול עצמאי או יכול להיארז לתוך חלקיקי פאג' ולבסוף להדביק מארח חיידקים E coli. כאשר מדביקים את תאי ה-E coli, הפאג f1 דורש נוכחות של פילוס. לפיכך, פילי המין חשובים במהלך אריזה חוץ גופית של פאגמידים.
מהם הדמיון בין קוסמיד לפאגמיד?
- שניהם Cosmid וגם Phagemid הם וקטורים שיבוטים המשמשים בטכנולוגיית DNA רקומביננטי.
- Cosmid ופאגמיד יכולים לשכפל DNA חד-גדילי ודו-גדילי.
- שניהם יכולים לעבור שכפול עצמאי בדומה לפלסמידים.
- Cosmid ופאגמיד יכולים לעבור אריזה חוץ גופית ולהדביק תאי חיידקים.
- הן קוסמיד והן פאגמיד דורשות מקור שכפול מתאים לצורך שיבוט.
מה ההבדל בין קוסמיד לפאגמיד?
Cosmid vs Phagemid |
|
| Cosmid הוא וקטור היברידי המכיל אתר cos ופלסמיד. | Phagemid הוא פלסמיד המכיל מקור F1 של שכפול של הפאג' F1. |
| נוכחות של אתרי Cos | |
| אתרי Cos קיימים ב-cosmid והם נחוצים לאריזה במבחנה. | אתרי Cos נעדרים בפאגמיד. |
| נוכחות של F1 מקור השכפול | |
| בקוסמיד, ייתכן שמקור השכפול יופיע או לא. | F1 מקור השכפול קיים בפאגמיד. |
| נוכחות של גנים עמידים לאנטיביוטיקה | |
| גנים עמידים לאנטיביוטיקה קיימים בקוסמידים כדי לזהות את הטרנספורמנטים מבלתי-טרנספורמנטים. | גנים עמידים לאנטיביוטיקה נעדרים בפאגמידים. |
| דרישה של אריזה במבחנה | |
| דרוש אתר cos. | דורש פילוס מין. |
סיכום – Cosmid vs Phagemid
Cosmid ו- Phagemid הם וקטורי שיבוט המשמשים בטכנולוגיית DNA רקומביננטי. קוסמידים הם וקטורים היברידיים המכילים קצוות דביקים מיוחדים המכונים אתרי cos. אריזה במבחנה דורשת אתרי cos אלה. בעוד שפאגמידים הם פלסמידים המכילים מקור f1 של שכפול המופק מפאג' f1. גם קוסמיד וגם פגמיד יכולים לעבור שכפול עצמאי או אריזה חוץ גופית לתאי חיידקים. אלו הם ההבדלים החשובים בין קוסמיד לפאגמיד.
