ההבדל העיקרי בין וקטורים להחדרה לוקטורים החלפה הוא שלווקטור ההחדרה יש את היכולת להחדיר אורכים מתונים של DNA זר בעוד שלווקטור חלופי יש את היכולת להכיל אורכים גדולים יותר של DNA זר.
ווקטורי פאג' הם הבקטריופאג'ים המשמשים לשיבוט. ישנם שני סוגים של וקטורי פאג'ים; הם וקטור הכנסת וקטור החלפה. כמו כן, כל וקטורי הפאג מורכבים מגנים לא חיוניים. עם זאת, יש להסיר גנים אלה מפאג'ים כדי לאפשר הכנסת DNA זר חדש.
מהו וקטור הכנסה?
קודם כל, וקטור הכנסה הוא הצורה הפשוטה ביותר של וקטורי שיבוט למבדה. למעשה, זהו סוג של וקטור פאג' שיש לו אתר הגבלה ייחודי המוכנס בגנום הווקטור במיקום של DNA אופציונלי. יתר על כן, ה-DNA הפאג נשאר ללא הסרה. אי הסרה זו של ה-DNA הפאג מצמצמת את גודל התוספות (DNA זר) שיש לשבט בווקטור. יתר על כן, וקטורים אלה שימושיים בשיבוט וביטוי cDNA. GT10, GT11 ו-Zap הם דוגמאות לוקטור זה.
איור 01: Lambda Phage
וקטור הכנסה מורכב מאתר זיהוי יחיד.תפקידו העיקרי של וקטור זה הוא לפתח ספריות cDNA שמקורן ברצפי mRNA אוקריוטיים. יתר על כן, הוא יכול להכיל רק אורכים של DNA זר הנעים בין 05-11 קילובייט. כמו כן, יש לו אתר מחשוף ייחודי להחדרת DNA זר.
מהם וקטורים חלופיים?
וקטור החלפה או וקטור החלפה הוא סוג של וקטור פאג' שפותח מהסרה של אזור 'שבר מילוי' אמצעי של ה-DNA של הפאג. הכנס ה-DNA הזר הרצוי מחליף את ה-DNA הפאג'.
איור 02: וקטור חלופי
וקטורים חלופיים חשובים ביצירת ספריות גנומיות כגון EMBL4 ו- Charon40. וקטורים אלה יכולים להכיל אורך גדול יותר של DNA זר בטווח שבין 08-24kb אורכי.אזור המילוי מורכב גם מגן שהופך את וקטור הפאג' ללא קיימא בתוך מארח חיידקי.
מהם הדמיון בין וקטורים להוספה והחלפה?
- וקטורי הכנסה והחלפה הם וקטורי פאג'.
- שני הוקטורים מתאימים להוספת DNA זר.
- שניהם מועילים ביצירת ספריות DNA.
מה ההבדל בין וקטורים להוספה להחלפה?
הוספה לעומת וקטורים החלפה |
|
| -Insertion Vector הוא סוג של וקטור פאג' שיש לו אתר הגבלה המוכנס בתוך גנום הפאג' באתר של DNA אופציונלי. | וקטור החלפה הוא סוג של וקטור פאג שפותח מהסרה של אזור 'שבר מילוי' אמצעי של ה-DNA של הפאג |
| גודל של שברי הוספה | |
| 05-11 kb length | 08-24 KB אורך |
| Filler Fragment | |
| ללא קטע מילוי | קטע מילוי מוחלף בתוספת לועזית |
| פונקציה | |
| חשוב ליצור ספריות cDNA | חשוב ביצירת ספריות גנום |
| דוגמאות | |
| GT10, GT11 ו-Zap הן דוגמאות | EMBL4 ו-Charon40 הן דוגמאות |
| אתר מחשוף | |
| קיים אתר מחשוף ייחודי | אתר המחשוף מכיל גנים שאינם חיוניים למחזור הליטי |
סיכום – וקטורים של הכנסה לעומת החלפה
שני סוגים של וקטורי פאג'ים הם הכנסה והחלפה. לשני הווקטורים יש אתרי הגבלה המקלים על ההתאמות של תוספות DNA זר חדשות. וקטורי החדרה חשובים ביצירת ספריות cDNA ואילו וקטורים חלופיים חשובים ביצירת ספריות גנומיות. יתר על כן, וקטורי החדרה מתאימים להוספת DNA באורך בינוני. אבל וקטורים חלופיים יכולים להכיל אורכים גבוהים יותר של הכנסת DNA זר. בסך הכל, זה ההבדל העיקרי בין וקטורים הכנסה והחלפה.
