ההבדל העיקרי בין TATA ל-CAAT הוא שקופסת TATA היא אזור נוקלאוטידים משומר שיש לו רצף קונצנזוס של TATAWAW ואילו תיבת CAAT היא אזור נוקלאוטידים משומר עם רצף קונצנזוס של GGCCAATCT.
תיבת TATA ו-CAAT הם שני אזורים של נוקלאוטידים המשפיעים על שעתוק גנים אוקריוטיים. הם רצפי DNA שאינם מקודדים שנמצאים במעלה הזרם לאתר התחלת התעתוק. למעשה, הם נמצאים באזור הרגולציה, אשר ידוע בתור האמרגן. גם תיבת TATA וגם תיבת CAAT אחראיות ליעילות התעתיק. הם רצפי קונצנזוס שלא השתנו לאורך התהליך האבולוציוני.
מה זה TATA Box?
TATA box או Goldberg-Hogness box הוא רצף קונצנזוס שנמצא באזור המקדם של גנים אוקריוטיים. תיבת TATA היא מרכיב ליבה של המקדם. הוא ממוקם 25 זוגות בסיסים במעלה הזרם של אתר התחלת התעתיק. הוא נשמר לאורך כל התהליך האבולוציוני. רצף הקונצנזוס של תיבת TATA הוא TATAWAW, כאשר W הוא או A או T. זהו רצף DNA שאינו מקודד. עם זאת, תיבת TATA חשובה לתעתוק הגן. זהו אתר הקישור של חלבון קושר TATA (TBP) וגורמי שעתוק אחרים. ברגע שהם נקשרים לקופסת ה-TATA, הגיוס של RNA פולימראז II וויסות נכון של שעתוק מתרחש בגנים איקריוטיים.
איור 01: TATA Box
מכיוון ש-TATA מעורב בוויסות התעתוק, מוטציות של קופסת TATA עלולות לגרום לשינויים פנוטיפיים המובילים למחלות כמו סרטן קיבה, אטקסיה ספינו-מוחית, מחלת הנטינגטון, עיוורון, β-תלסמיה, דיכוי חיסוני, תסמונת גילברט, ו-HIV-1 וכו'.
מה זה CAAT Box?
קופסת CAAT היא אזור של נוקלאוטידים עם רצף הקונצנזוס של GGCCAATCT. בדומה לקופסת TATA, תיבת CAAT ממוקמת גם באזור הפרומוטור של הגן. לכן, הוא ממוקם כ-75-80 זוגות בסיסים במעלה הזרם לאתר התעתיק.
איור 02: תיבת CAAT
גורמי תמלול ספציפיים נקשרים לתיבת CAAT. קשירה זו מייצבת את קומפלקס קדם-התחיל לקשירה קלה יותר של האנזים RNA פולימראז. באופן דומה, תיבת ה-CAAT פועלת כרצף רגולטורי. מוטציות באזור תיבת CAAT משפיעות מאוד על תגובת המקדם וויסות התעתוק.
מהם הדמיון בין TATA ל-CAAT Box?
- TATA ו-CAAT הם שני אזורים של נוקלאוטידים המצויים ברצף הרגולטורי של גנים אוקריוטיים.
- הם נמצאים במעלה הזרם לאתר התחלת התמלול.
- שניהם הם רצפי DNA קונצנזוס.
- הם חיוניים לוויסות התעתיק, ולכן הם רצפים רגולטוריים.
מה ההבדל בין TATA ל-CAAT Box?
TATA box הוא אזור נוקלאוטידים שמור שנמצא כ-25-30 זוגות בסיסים במעלה הזרם לאתר התחלת התעתוק. מצד שני, תיבת CAAT היא אזור שמור של נוקלאוטידים שנמצא בערך 75-80 זוגות בסיסים במעלה הזרם לאתר התחלת השעתוק. אז זה ההבדל העיקרי בין תיבת TATA ל-CAAT. חוץ מזה, לתיבת TATA יש רצף קונצנזוס של TATAWAW בעוד ש-GGCCAATCT הוא רצף הקונצנזוס של תיבת CAAT.
יתר על כן, הבדל משמעותי נוסף בין TATA ל-CAAT תיבת הוא שקופסת ה-TATA מספקת אתר קישור ל-TBP וגורמי שעתוק ומשתתפת בוויסות השעתוק בעוד שקופסת ה-CAAT מאותתת לאתר הקישור לגורם שעתוק ה-RNA.
להלן אינפוגרפיקה מסכמת את ההבדלים בין TATA לתיבה CAAT.
סיכום – TATA לעומת CAAT Box
תיבת TATA ו-CAAT הם שני חלקים מהאזור השמור של מקדמי גנים אוקריוטיים. הם ממוקמים במעלה הזרם לאתר התחלת התמלול. שניהם משפיעים על שעתוק הגנים על ידי מתן אתרים לקשירת חלבונים קושרי TATA וגורמי התחלת שעתוק. תיבת TATA ממוקמת 25-35 זוגות בסיסים במעלה הזרם של אתר התחלת התעתוק ואילו תיבת CAAT ממוקמת 75-80 זוגות בסיסים במעלה הזרם לאתר התחלת התעתוק. רצף הקונצנזוס של תיבת TATA הוא TATAWAW בעוד שרצף הקונצנזוס של תיבת CAAT הוא GGCCAATCT. לפיכך, זהו סיכום ההבדל בין תיבת TATA ל-CAAT.
