ההבדל העיקרי בין שיפוע סוכרוז לאולטרה-צנטריפוגה של כרית סוכרוז הוא שבאולטרצנטריפוגה של שיפוע סוכרוז, משתמשים בגרדיאנט סוכרוז רציף, בעוד שבאולטרה-צנטריפוגה של כרית סוכרוז משתמשים בשיפוע סוכרוז לא רציף.
שיפוע סוכרוז וכרית אולטרה-צנטריפוגה של סוכרוז הם שני סוגים דומים של טכניקות המשמשות להפרדת סוגים ספציפיים של מקרומולקולות. בשתי הטכניקות, נעשה שימוש בשיפוע צפיפות סוכרוז. אבל באולטרה-צנטריפוגה של שיפוע סוכרוז, נעשה שימוש בשיפוע צפיפות מתמשך בעוד שבאולטרה-צנטריפוגה של כרית סוכרוז, נעשה שימוש בשיפוע צפיפות לא רציף.
מהי אולטרה-צנטריפוגה של גרדיאנט סוכרוז?
אולטרה צנטריפוגה של שיפוע סוכרוז היא טכניקה שניתן להשתמש בה כדי לחלק מקרומולקולות כגון DNA, RNA וחלבונים. ישנם מספר שלבים בטכניקה זו. הם הכנת גרדיאנט סוכרוז, צנטריפוגה, הפרדה ואלוציה. הכנת שיפוע היא שלב המפתח בטכניקה זו. בטכניקה זו, הדגימה המכילה מקרומולקולות בגדלים שונים מונחת על פני השטח של עמודת שיפוע סוכרוז. בעת צנטריפוגה, מקרומולקולות בגדלים שונים משקעים דרך עמודת שיפוע הסוכרוז בקצבים שונים. שקיעה תלויה במספר גורמים, כולל כוח הצנטריפוגה, צורת הגודל וצפיפות המקרומולקולות, צפיפות וצמיגות השיפוע. בתום הצנטריפוגה, מקרומולקולות מופרדות במרחב על ידי צפיפות. מקרומולקולות גדולות יותר (מקרומולקולות בצפיפות גבוהה) משקעים לכיוון הקרקעית. קלים יותר (מאקרומולקולות בצפיפות נמוכה) נשארות בחלק העליון של הגרדיאנט.לכן, המולקולות נפרדות כרצועות שונות. לאחר מכן יש להפריד את הרצועות, ויש לבצע את הטיהור של המקרומולקולה הספציפית מסוכרוז.
איור 01: Ultracentrifugation Gradient של סוכרוז
בצד היישום, שיטה זו נמצאת בשימוש נרחב לחלוקה של מולקולות DNA. אולטרה צנטריפוגה של שיפוע סוכרוז משמש בדרך כלל לאפיון גודל והרכב חלבונים. יתר על כן, טכניקה זו משמשת לטיהור חלקי של mRNA.
מהי אולטרה-צנטריפוגה של כרית סוכרוז?
Ultracentrifugation של כרית סוכרוז היא טכניקה נוספת המאפשרת חלוקה של מקרומולקולות. שלא כמו אולטרצנטריפוגה של שיפוע צפיפות סוכרוז, אולטרה צנטריפוגה של כרית סוכרוז משתמשת בשיפוע צפיפות לא רציף.ריכוז הסוכרוז עולה מלמעלה למטה בצעדים נפרדים. בטכניקה זו, ההפרדה מושגת על ידי הנחת התמצית הבהירה על גבי נפח קטן של תמיסת סוכרוז בצינור צנטריפוגה, מה שנקרא כרית סוכרוז. זה מאפשר הפרדה טובה יותר בצנטריפוגה במהירות גבוהה. כאשר המולקולות נפרדות כרצועה בין כרית הסוכרוז, ניתן לאסוף את הרצועה הלבנה ולטהר אותה. יתר על כן, ניתן להסיר עוד יותר זיהומים באמצעות שיטת כרית סוכרוז. שיטת כרית סוכרוז מאפשרת מילוי של 60-70% מהצינור בדגימה. לפיכך, שיטת כרית הסוכרוז מאפשרת לעבד נפח גדול יותר של דגימה.
מהם הדמיון בין שיפוע סוכרוז ל-Ultracentrifugation של כרית סוכרוז?
- שיפוע סוכרוז וכרית אולטרה-צנטריפוגה של סוכרוז הן שתי טכניקות המשמשות להפרדת תערובת של מקרומולקולות.
- בשתי השיטות, נעשה שימוש בשיפוע סוכרוז.
- צנטריפוגציה היא שלב בשתי השיטות.
- המולקולות משתקעות כרצועה או אזור בכל שיטה.
מה ההבדל בין שיפוע סוכרוז לכרית אולטרה-צנטריפוגה של סוכרוז?
אולטרה-צנטריפוגה של שיפוע סוכרוז היא טכניקה המשתמשת בשיפוע סוכרוז רציף בצינור הצנטריפוגה ואילו אולטרה-צנטריפוגה של כרית סוכרוז היא טכניקה המשתמשת בשיפוע סוכרוז לא רציף. לפיכך, זהו ההבדל העיקרי בין שיפוע סוכרוז לבין אולטרה צנטריפוגה של כרית סוכרוז.
יתר על כן, אולטרה-צנטריפוגה של כרית סוכרוז מאפשרת לעבד נפח גדול יותר של הדגימה בעוד שאולטרה-צנטריפוגה שיפוע סוכרוז מאפשרת לעבד נפח נמוך יחסית של הדגימה.
למטה אינפוגרפיקה מציגה הבדלים נוספים בין שיפוע סוכרוז ואולטרה-צנטריפוגה של כרית סוכרוז.
סיכום – שיפוע סוכרוז לעומת כרית סוכרוז אולטרה-צנטריפוגה
אולטרה צנטריפוגה של שיפוע סוכרוז מפרידה בין מקרומולקולות באמצעות שיפוע סוכרוז רציף. לעומת זאת, אולטרנטריפוגציה של כרית סוכרוז משתמשת בשיפוע סוכרוז לא רציף על מנת להפריד סוג מסוים של חלקיקים בתערובת. אז זה ההבדל העיקרי בין שיפוע סוכרוז לאולטרנטריפוגציה של כרית סוכרוז. שיטת כרית הסוכרוז מאפשרת איסוף של חלקיקים שלמים מבחינה מורפולוגית מאחר והיא אינה גורמת ללחץ מכני, בשונה מאולטרה צנטריפוגה של שיפוע סוכרוז, אשר מועך מולקולות לתחתית הצינור. יתר על כן, אולטרה צנטריפוגה של כרית סוכרוז מאפשרת לעבד נפח גדול יותר של הדגימה מאשר אולטרה צנטריפוגה של שיפוע סוכרוז.
