ההבדל העיקרי בין אינטרונים מקבוצה I לקבוצה II הוא שבאינטרונים מקבוצה I, תגובת השחבור יזומה על ידי קו-פקטור גואנוזין, בעוד שבאינטרונים מקבוצה II, תגובת השחבור יזומה על ידי אדנוזין פנימי.
Pre-mRNA הוא התמליל העיקרי שיש בו גם אינטרונים וגם אקסונים. Pre-mRNA צריך להמיר ל-mRNA לפני התרגום. שחבור RNA או שחבור טרום-mRNA הוא שינוי כזה לאחר שעתוק. בשחבור RNA, אינטרונים מוסרים ממולקולת הפרה-mRNA, ואקסונים מחוברים זה לזה. אינטרונים מקבוצה I וקבוצה II הם אינטרונים שחבורים עצמיים. הם מתחלקים ממולקולת טרום-mRNA ללא עזרה של כל אנזים אחר.לכן, הם אנזימי RNA או ריבוזימים המזרזים את השחבור שלהם מקדם-mRNA. יתר על כן, יש להם את היכולת לתפקד כאלמנטים ניידים. במהלך השחבור, מתרחשת סדרה של תגובות טרנס-אסטריפיקציה על מנת לכרות את האינטרון ולקשור את האקסונים. ריבוזימים אלו קיימים בכל שלושת התחומים, כולל חיידקים, ארכאים ואיקריוטים.
מהם Introns Group I?
אינטרונים מקבוצה I הם סוג של ריבוזימים שחבורים עצמיים המצויים בחיידקים, בקטריופאג'ים ובאיקריוטים (גנום אברוני וגרעיני). הם נמצאים בגנים חיוניים. הם מסוגלים לזרז את השחבור שלהם ממולקולת הפרה-mRNA. לאינטרונים מקבוצה I עשויים להיות כמה מאות עד שלושת אלפים נוקלאוטידים. יתר על כן, הם מפגינים דמיון קטן ברצף בין אורגניזמים.
איור 01: Introns Group I
המבנים המשניים נשמרים מאוד בארבעה אזורים קצרים. ישנם שני שלבי תגובת טרנסיפיקציה של שחבור. אינטרונים מקבוצה I יוזמים מנגנון שחבור על ידי התקפה נוקלאופילית של ההידרוקסיל 3' של קופקטור גואנוזין באתר החבור 5P.
מהם אינטרונים מקבוצה II?
אינטרונים מקבוצה II הם סוג של אינטרונים שחבורים עצמיים המצויים באורגניזמים השייכים לכל שלושת התחומים. הם ריבוזימים המזרזים את תגובות השחבור שלהם מקדם-mRNA. הם נמצאים בגנים מקודדי חלבון rRNA, tRNA. אבל הם לא נמצאים בגנומים גרעיניים, בניגוד לאינטרונים מקבוצה I.
איור 02: Introns Group II
אינטרונים מקבוצה II מזרזים שחבור באמצעות שני שלבי טרנסיפיקציה הדומים לאינטרונים מקבוצה I.אנזימים אלו מתחילים את תגובת השחבור על ידי התקפת נוקלאופילית של 2' OH של אדנוזין של אתר הסניף בצומת החבור 5'. במהלך תגובות שחבור, אינטרונים מקבוצה II יוצרים מבנה דמוי לאריאט. יתר על כן, שחבור אינטרונים מתרחש בהיעדר GTP.
מה הם קווי הדמיון בין אינטרונים מקבוצה I לקבוצה II?
- אינטרונים מקבוצה I וקבוצה II הם שני סוגים של אנזימי RNA, ריבוזימים המזרזים את השחבור שלהם במנגנונים שונים.
- הם ריבוזימים גדולים.
- שניהם נמצאים בכל שלושת הדומיינים.
- הם רכיבים ניידים.
- יתר על כן, הם נמצאים בגנים מקודדי rRNA, tRNA וחלבון.
- שני האנזימים משתמשים ככלים בביוטכנולוגיה וברפואה מולקולרית למערכות נוק-אאוט/נוק-אאוט ממוקדות של גנים, מסירת גנים או מערכות ריפוי גנטי.
מה ההבדל בין אינטרונים מקבוצה I לקבוצה II?
אינטרונים מקבוצה I הם ריבוזימים המצויים בחיידקים, בקטריופאג'ים ובגנום אברוני וגרעיני אוקריוטי. אינטרונים מקבוצה II הם ריבוזימים המצויים בחיידקים, ארכאים ואברונים אוקריוטיים. יתר על כן, האינטרונים מקבוצה I יוזמים תגובת שחבור על ידי התקפה נוקלאופילית של הידרוקסיל 3' של קופקטור גואנוזין באתר השבר 5P בעוד שאינטרונים מקבוצה II יוזמים תגובת שחבור על ידי התקפה נוקלאופילית של ה-2' OH של אדנוזין באתר הסניף. צומת ספייס 5′. אז זה ההבדל העיקרי בין אינטרונים מקבוצה I לקבוצה II.
יתר על כן, אינטרונים מקבוצה II יוצרים מבנה דמוי לאריאט במהלך השחבור בעוד שאינטרונים מקבוצה I אינם נוצרים. לפיכך, זהו הבדל משמעותי נוסף בין אינטרונים מקבוצה I לקבוצה II. חוץ מזה, האינטרונים מקבוצה I נמצאים בגנום גרעיני אוקריוטי בעוד שאינטרונים מקבוצה II אינם נמצאים בגנום גרעיני אוקריוטי.
להלן אינפוגרפיקה מפרטת את ההבדלים בין אינטרונים מקבוצה I לקבוצה II בצורה טבלה להשוואה זה לצד זה.
סיכום – קבוצה I נגד Group II Introns
אינטרונים מקבוצה I ו-II הם ריבוזימים גדולים המזרזים תגובת טרנסיפיקציה כדי לשבור אינטרונים מהתעתיק הראשי. הם נמצאים בכל שלושת התחומים. שניהם אלמנטים גנטיים ניידים. יתרה מכך, הם משמשים ככלים בביוטכנולוגיה וברפואה מולקולרית. עם זאת, האינטרונים מקבוצה I יוזמים תגובת שחבור על ידי התקפה נוקלאופילית של 3′ OH של קופקטור גואנוזין באתר החבור 5P. אבל, האינטרונים מקבוצה II יוזמים תגובת שחבור על ידי התקפה נוקלאופילית של ה-2′ OH של אדנוזין של אתר הענף בצומת 5′ splice. יתר על כן, אינטרונים מקבוצה II יוצרים מבנה דמוי לאריאט במהלך השחבור בעוד שאינטרונים מקבוצה I אינם יוצרים מבנה דמוי לאריאט.לפיכך, זהו סיכום ההבדל בין אינטרונים מקבוצה I לקבוצה II.
