ההבדל העיקרי בין מקשר למתאם הוא שלמקשר אין קצוות מלוכדים בעוד שלמתאם יש קצה מלוכד אחד.
קשירת DNA הוא תהליך של חיבור שתי מולקולות DNA יחד, ויוצרים קשרי פוספודיסטר. האנזים הנקרא DNA ליגאז מזרז תגובה זו. זהו אחד השלבים הקריטיים בתחומים ביולוגיים מולקולריים מודרניים כמו טכנולוגיית DNA רקומביננטי ושיבוט DNA. יעילות הקשירה תלויה בקצוות של מולקולות ה-DNA שיש לקשור. ישנם שני סוגים של קצוות DNA כקצוות דביקים וקצוות קהים. יעילות הקשירה גבוהה עם קצוות דביקים מאשר עם קצוות קהים. אם למולקולות ה-DNA של המטרה יש קצוות קהים, מולקולות הנקראות מתאמים או קישורים יהיו שימושיות.מתאמים ומקשרים הם מולקולות אוליגונוקלאוטידים מסונתזות כימית המסייעות בקשירת DNA. יש להם גם אתרי הגבלה פנימיים. למתאם יש קצה דביק אחד וקצה קהה אחד, בעוד שלמקשר יש שני קצוות קהים.
מהו קישור?
קישור הוא רצף אוליגונוקלאוטידים מסונתז כימי בעל כפול גדילים. לקשר יש שני קצוות קהים. קישור משמש לקשירת מולקולות DNA שיש להן קצוות קהים לוקטורים. הוא מכיל אתרי הגבלה פנימיים אחד או יותר. אתרי הגבלה אלה פועלים כאתרי זיהוי עבור אנזימי הגבלה.
איור 01: קישור
לאחר קשירה, ה-DNA מוגבל שוב עם אנזימי הגבלה כדי לייצר קצוות מלוכדים. קישורי EcoRI ומקשרי sal-I הם קישורים נפוצים.
מהו מתאם?
An Adapter הוא רצף אוליגונוקלאוטידים דו-גדילי המשמש לקישור בין שתי מולקולות DNA. זהו רצף קצר עם קצה אחד קהה וקצה אחד דביק או מגובש. לכן, הוא מורכב מזנב חד-גדילי בקצה אחד, מה שמשפר את היעילות של קשירת DNA.
איור 02: קשירת DNA באמצעות מתאם
יתר על כן, למתאם יש אתרי הגבלה פנימיים. לכן, לאחר קשירה, ניתן להגביל את ה-DNA באמצעות אנזימי הגבלה מתאימים על מנת ליצור קצה חדש בולט. חסרון אחד של מתאמים הוא ששני מתאמים יכולים ליצור דימרים על ידי זיווג בסיס עם עצמם. ניתן להימנע מכך על ידי טיפול באנזים הנקרא פוספטאזה אלקליין.
מהם הדמיון בין קישור למתאם?
- שני המקשר וגם המתאם הם רצפי אוליגונוקלאוטידים קצרים דו-גדיליים.
- הם נושאים אתרי הגבלות פנימיים.
- יתר על כן, הן מולקולות DNA מסונתזות כימית והן מולקולות סינתטיות.
- הם יכולים לקשר שתי מולקולות DNA יחד.
- לאחר קשירה של קישורים ומתאמים, ה-DNA שוב מוגבל באמצעות אנזימי הגבלה על מנת לייצר קצוות דביקים.
מה ההבדל בין קישור למתאם?
A מקשר הוא דופלקס אוליגונוקלאוטיד קצר מסונתז כימית עם שני קצוות קהים. מתאם הוא דופלקס אוליגונוקלאוטיד קצר מסונתז כימי עם קצה דביק אחד וקצה אחד קהה. לפיכך, זהו ההבדל העיקרי בין מקשר למתאם. יתר על כן, מתאמים יכולים ליצור דימרים, בעוד שמקשרים אינם יוצרים דימרים. אז זהו הבדל משמעותי נוסף בין מקשר למתאם.
להלן סיכום ההבדלים בין מקשר למתאם בצורת טבלה.
סיכום – קישור מול מתאם
קישור ומתאם הם שני סוגים של אוליגונוקלאוטידים מסונתזים כימית, שימושיים בקשירת DNA עם קצה קהה. ל-Linker שני קצוות קהים, בעוד למתאם יש קצה אחד קהה וקצה אחד מגובש. אז זה ההבדל העיקרי בין מקשר למתאם. הן מולקולות דו-גדיליות שיש להן אתרי הגבלה פנימיים. הם נמצאים בשימוש נרחב בטכנולוגיית DNA רקומביננטי ושיבוט DNA.
