ההבדל העיקרי בין טרנספוזונים מרוכבים לאלמנטים IS הוא שטרנספוזונים מרוכבים הם סוג של טרנספוזונים שנושאים גנים נלווים כגון גנים עמידות לאנטיביוטיקה, בעוד שאלמנטים IS (או רכיבי רצף ה-Insertion) הם אלמנטים הניתנים להעברה הנושאים רק גנים שנושאים קוד טרנספוזיס המזרז את פעילות הטרנספוזיציה.
טרנספוזון הוא קטע של DNA שיכול לשנות את מיקומו בתוך הגנום החיידקי. לכן, הם רצפי DNA ניידים. הם עוברים למיקומים חדשים של הגנום, מבצעים שינויים ברצף של הגנום החיידקי, וגורמים לשינויים משמעותיים במידע הגנטי.טרנספוזונים ידועים גם כגנים קופצים מכיוון שהם יכולים לחסום את שעתוק הגנים ולסדר מחדש את החומר הגנטי של החיידק. יתר על כן, הם אחראים לתנועה של עמידות לתרופות, גנים של עמידות לאנטיביוטיקה בין פלסמידים וכרומוזומים. טרנספוזונים מרוכבים ואלמנטים IS הם שני סוגים של אלמנטים גנטיים ניידים המצויים בחיידקים. שניהם יכולים לעבור ממיקום אחד לאחר בגנום.
מהם טרנספוזונים מרוכבים?
טרנספוזון מורכב הוא קטע של DNA שבצדו שני עותקים של רכיבי רצף הכנסה דומים. יש אזור מרכזי המקודד חלבון בטרנספוזון המרוכב. הגנים הם לרוב גנים עמידים לאנטיביוטיקה. הם גם יכולים להכיל גנים קטבוליים. יתר על כן, טרנספוזון מורכב מורכב משתי חזרות הפוכות. כל האורך של הטרנספוזון המרוכב נע כיחידה אחת שלמה.
איור 01: Transposon Composite
Tn10 הוא טרנספוזון מורכב. הוא מורכב מאזור קידוד מרכזי של 6.5 ק"ב (גן עמיד לטטרציקלין) ואלמנטים של רצף החדרה הפוך של 1.4 ק"ב בכל קצה. אלמנטים של IS מספקים טרנספוזה. טרנספוסאז הוא אנזים המזרז את תנועת הטרנספוזון. ניתן להגביר טרנספוזונים מרוכבים, תוך עיצוב פריימרים עבור אלמנטים IS.
מה הם IS Elements?
אלמנטים של רצף הכנסה או רכיבי IS הם סוג של אלמנט גנטי נייד. הם צורה פשוטה של טרנספוזונים. הם נושאים רק את הגנים המקודדים לאנזימי טרנספוזאז. אנזימי טרנספוזז מזרזים את הטרנספוזיציה של טרנספוזונים. מבחינה מבנית, רצף הקידוד של רכיבי IS מוקף בשתי חזרות הפוכות. לדוגמה, אלמנט IS הנקרא IS911 מוקף בשני קצוות חוזרים הפוכים של 36bp.
יסודות IS הם האלמנטים האוטונומיים הנפוצים ביותר בגנום החיידקי. לפיכך, הם חשובים ביותר לארגון ואבולוציה של הגנום הפרוקריוטי. יתר על כן, אלמנטים של IS מתרחשים כחלקים של טרנספוזונים מרוכבים. בדרך כלל, שני אלמנטים IS נמצאים לצד רצף הקידוד של הטרנספוזון המרוכב. אבל, טרנספוזונים של יחידות אינם נושאים אלמנטים של IS מאגפים.
מכיוון שאלמנטים של IS יכולים לנוע בתוך הגנום, הם יכולים לקטוע את רצף הקידוד של גנים אחרים ולהשבית את הגנים על ידי חסימת ביטוי.
מהם הדמיון בין טרנספוזונים מרוכבים ואלמנטים IS?
- גם טרנספוזונים מרוכבים וגם אלמנטים IS מסוגלים לשנות את המיקום בגנום החיידקי.
- אזור הקידוד בשני הטרנספוזונים מוקף בדרך כלל בחזרות הפוכות.
- טרנספוזון מורכב מוקף בשני רכיבי IS נפרדים.
מה ההבדל בין טרנספוזונים מרוכבים ואלמנטים IS?
טרנספוזונים מרוכבים הם אלמנטים גנטיים ניידים המורכבים משני רצפי החדרה (ISs) שמצמידים לרוב גן עמידות לאנטיביוטיקה אחד או יותר. מצד שני, יסודות IS הם סוג של אלמנט פשוט שניתן להעברה המכיל גנים המקודדים לאנזים טרנספוזאז כדי לזרז טרנספוזיציה. אז זה ההבדל העיקרי בין טרנספוזונים מרוכבים לרכיבי IS.
להלן רשימה של הבדלים בין טרנספוזונים מרוכבים לרכיבי IS בצורת טבלה להשוואה זה לצד זה.
סיכום – טרנספוזונים מרוכבים לעומת אלמנטים IS
לגנום חיידקי יש אלמנטים גנטיים שהם ניידים.טרנספוזונים מרוכבים ואלמנטים IS הם שני סוגים של אלמנטים גנטיים ניידים. טרנספוזונים מרוכבים נושאים גנים עמידים לאנטיביוטיקה ואלמנטים אגפים של IS. אלמנטים של IS נושאים את הקוד הגנטי לייצור טרנספוזז אשר מזרז את תנועת הטרנספוזונים. לפיכך, זהו ההבדל העיקרי בין טרנספוזונים מרוכבים לרכיבי IS.