ההבדל העיקרי בין תת-יחידת חלבון לתחום הוא שתת-יחידת חלבון היא שרשרת פוליפפטידית נפרדת של חלבון שמתכנסת עם שרשראות פוליפפטידיות אחרות ליצירת קומפלקס חלבון בעוד שתחום חלבון הוא אזור רציף בשרשרת הפוליפפטידית של חלבון שמתקפל לעתים קרובות באופן עצמאי ליחידה קומפקטית, מקומית וחצי עצמאית.
תת-יחידת חלבון ודומיין הם חלקים חשובים מאוד של חלבון מולטימרי. חלבונים הם פולימרים העשויים מפוליפפטידים. כל שרשרת פוליפפטידית נבנית ממונומר המכונה חומצת אמינו. חלבון מורכב מכיל יחידות מבניות מובחנות כגון תת-יחידות, תחומים, מוטיב וקיפול.יחידות מבניות אלו של חלבון מורכב חשובות ביותר למבנה שלו ובסופו של דבר לתפקודו.
מהי תת-יחידת חלבון?
תת-יחידת חלבון היא שרשרת פוליפפטידית נפרדת של חלבון שמתכנסת עם שרשראות פוליפפטידיות אחרות ליצירת קומפלקס חלבון. בביולוגיה מבנית, תת-יחידת חלבון היא מולקולת חלבון אחת שמתכנסת יחד עם מולקולות חלבון אחרות ליצירת קומפלקס חלבון. לחלבונים המופיעים באופן טבעי יש מספר קטן יחסית של תת-יחידות, כגון המוגלובין ו-DNA פולימראז. לכן, הם נקראים אוליגומרים. חלבונים אחרים מורכבים ממספר רב של יחידות משנה, ולכן הם מתוארים כמולטימריים. לדוגמה, מיקרוטובולים וחלבוני ציטושלד אחרים הם מולטימריים. תת-היחידות של חלבון מולטימרי עשויות להיות זהות (הומולוגיות) או שונות לחלוטין (הטרולוגיות).
איור 01: תת-יחידת חלבון
בחלבונים מולטימריים מסוימים, תת-יחידה אחת עשויה להיות תת-יחידה קטליטית. מצד שני, השני הוא תת-יחידה רגולטורית. תפקידה של תת-היחידה הקטליטית הוא לזרז את התגובה האנזימטית בעוד שתפקידה של תת-היחידה הרגולטורית מקלה או מעכבת את פעילותה. אנזים המורכב מתת-יחידות קטליטיות וגם מווסתות כשהוא מורכב מכונה בדרך כלל הולו-אנזים. לדוגמה, לאנזים class I phosphoinositide 3-kinase יש תת-יחידה קטליטית p110 ותת-יחידה מווסתת p85. יתר על כן, לחלבון חייב להיות גן אחד לכל תת-יחידה. הסיבה לכך היא שתת-יחידה מורכבת משרשרת פוליפפטידית נפרדת שיש לה גן מקודד אחד.
מהו תחום חלבון?
תחום חלבון הוא אזור רציף בשרשרת הפוליפפטידית של חלבון שמתקפל לעתים קרובות באופן עצמאי ליחידות קומפקטיות, מקומיות וחצי עצמאיות.התחום של חלבון ידוע גם כאזור בשרשרת הפוליפפטידית של חלבון המייצב את עצמו ומתקפל באופן עצמאי מהשאר. הם יחידה מבנית ותפקודית מובהקת בחלבון. בדרך כלל, תחומים אחראים לתפקוד ספציפי או לאינטראקציה שתורמת לתפקיד הכולל של החלבון. לדוגמה, תחום SH3 הוא בסביבות 50 שיירי חומצות אמינו. הם מופיעים במגוון רחב של חלבונים, כולל חלבוני מתאם, phophatidylinositol3-kinases, phospholipases ומיוזינים. תחומי SH3 אלה מעורבים באינטראקציות חלבון-חלבון.
איור 02: תחום חלבון
התחומים משתנים באורכם מ-50 חומצות אמינו ל-250 חומצות אמינו. התחומים הקצרים ביותר, כגון אצבע אבץ, מיוצבים על ידי יוני מתכת וגשרי דיסולפיד.תחום מייצר לעתים קרובות יחידות פונקציונליות כמו תחום ה-EF-יד קושר סידן של קלמודולין. יתר על כן, ניתן להחליף תחומים באמצעות הנדסה גנטית בין חלבון אחד למשנהו כדי ליצור חלבונים כימריים.
מהם הדמיון בין תת-יחידת חלבון לדומיין?
- יחידת המשנה והדומיין של חלבון הם יחידות מבניות של חלבון מולטימרי.
- שניהם מורכבים מחומצות אמינו.
- הם קשורים למונח "שרשרת פוליפפטיד".
- יתר על כן, שניהם חשובים ביותר לתפקוד הכללי של החלבון.
מה ההבדל בין תת-יחידת חלבון לדומיין?
תת-יחידת חלבון היא שרשרת פוליפפטידית נפרדת של חלבון שמתכנסת עם שרשראות פוליפפטידיות אחרות ליצירת קומפלקס חלבון. מצד שני, תחום חלבון הוא אזור רציף בשרשרת הפוליפפטידית של חלבון שמתקפל לעתים קרובות באופן עצמאי ליחידות קומפקטיות, מקומיות וחצי עצמאיות.אז זה ההבדל העיקרי בין תת-יחידת חלבון לתחום. יתרה מכך, תת-יחידת חלבון גדולה יותר מתחום חלבון.
הטבלה הבאה מסכמת את ההבדל בין תת-יחידת חלבון לתחום בצורה טבלאית.
סיכום – תת-יחידת חלבון לעומת דומיין
אבני הבניין של חלבונים הן חומצות אמינו. חלבונים נוצרים על ידי עיבוי של חומצות אמינו. גודלם של מבני חלבון נע בין עשרות לכמה אלפי חומצות אמינו. מבנה חלבוני מיוצב על ידי אינטראקציות לא קוולנטיות כגון קשרי מימן, קשרים יוניים, כוחות ואן דר וואלס, קשרים הידרופוביים ואינטראקציות קוולנטיות כגון קשרי דיסולפיד. חלבון מורכב מכיל יחידות מבניות מובחנות כגון תת-יחידות, תחומים, מוטיב וקיפול. תת-יחידת חלבון היא שרשרת פוליפפטידית נפרדת של חלבון שמתכנסת עם שרשראות פוליפפטידיות אחרות ליצירת קומפלקס חלבון. מצד שני, תחום החלבון הוא אזור בשרשרת הפוליפפטידית של החלבון המייצב את עצמו ומתקפל באופן עצמאי מהשאר.לפיכך, זהו סיכום ההבדל בין תת-יחידת חלבון לתחום.
