ההבדל העיקרי בין מוטיב לתחום הוא שהמוטיב אינו יציב באופן עצמאי בעוד שהתחום יציב באופן עצמאי.
חלבונים הם מקרומולקולות ביולוגיות חשובות הקיימות בגופנו. מצד שני, הקוד הגנטי של גן יקבע את רצף חומצות האמינו של חלבון. יתר על כן, לחלבונים יש מבנים ראשוניים, משניים ושלישוניים. המבנה הראשוני הוא רצף חומצות האמינו של שרשרת הפוליפפטידים. כאשר שרשראות פוליפפטידים מתקפלות זו עם זו, זה יוצר את המבנה המשני של החלבון. סלילי אלפא, גיליונות בטא ומבנים על-משניים שייכים למבנים המשניים.קבוצות מסוימות של יסודות על-משניים ידועים כמוטיבים של חלבון. המבנה השלישוני של חלבון מתייחס למבנה התלת מימדי שלו שקובע את תפקוד החלבון. תחום הוא קטע מקופל של מולקולת חלבון, שהיא כדורית ובעלת פונקציה נפרדת. זהו המבנה הפונקציונלי והתלת מימדי הבסיסי של החלבון.
מהו מוטיב?
מוטיב הוא קיבוץ מסוים של האלמנטים העל-משניים של חלבונים כגון סלילי אלפא ומבני בטא. הם סוג של דפוסים הקיימים בחלבונים שונים. מוטיבים מתארים את דפוסי הקיפול של האלמנטים המבניים המשניים ואת האינטראקציות ביניהם. דפוסי קיפול אלו מתייצבים על ידי קישורים דומים הקיימים במבנים שלישוניים. עם זאת, הם אינם מורכבים כמו מבנים שלישוניים.
איור 01: מוטיב
הם שילובים פשוטים של מבנים משניים של חלבונים. המוטיב אינו יציב בפני עצמו. יתר על כן, מוטיבים מסבירים את המבנה של חלבון אך אינם מנבאים את תפקודו של חלבון. דוגמאות למוטיבים של חלבון הם מוטיב בטא-אלפא-ביתא, מוטיב מפתח יווני, חבית בטא, מוטיב בטא-מתפתל וכו'.
מהו דומיין?
דומיין הוא יחידה בסיסית, פונקציונלית ותלת מימדית של חלבון. הוא מבצע פונקציה מסוימת. לחלבון בודד יכולים להיות מספר תחומים נפרדים. כל תחום הוא יחידה עצמאית. זהו מבנה כדורי. הוא אחראי על פונקציה או אינטראקציה ספציפיים. ניתן להשתמש בתחומים כדי לשער את התפקוד של חלבון לא מאופיין. כאשר מנתחים חלבון, חיוני לקחת בחשבון שכן תחומים הם היחידות הפונקציונליות של החלבון.
איור 02: שלושה תחומים שונים של Pyruvate Kinase
דומיינים הם מבנים מאוד יציבים וקומפקטיים. ניתן להבחין ביניהם בקלות מאזורים אחרים. ל-Pyruvate kinase יש שלושה תחומים להבחין כפי שמוצג באיור 02. אורך התחום יכול להשתנות, והאורך הממוצע הוא 100 חומצות אמינו. כל תחום מכיל ליבה הידרופובית הבנויה מיחידות מבניות משניות. מספר תחומים יוצרים ביחד את המבנה השלישוני של חלבון.
מהם הדמיון בין מוטיב לתחום?
- מוטיב ותחום הם יחידות הקיימות במולקולות החלבון עצמן.
- הם שימושיים בעת סיווג משפחות חלבון.
מה ההבדל בין מוטיב לתחום?
מוטיב הוא קבוצה מסוימת של האלמנטים העל-משניים של חלבונים כגון סלילי אלפא ומבני ביתא בעוד שתחום הוא היחידה התפקודית של חלבון.יתר על כן, מוטיב הוא מבנה משני בעוד שהתחום אחראי למבנה השלישוני של החלבון. יתרה מכך, תחום הוא יחידה עצמאית, בניגוד למוטיב. כמו כן, תחום מתאר את הפונקציה של חלבון בעוד המוטיב אינו. אלו ההבדלים העיקריים בין מוטיב לתחום. האינפוגרפיקה שלהלן מציגה את ההבדל בין מוטיב לתחום בצורת טבלה.
סיכום – מוטיב לעומת דומיין
מוטיב הוא סידור של מבנים משניים של מולקולת החלבון. זה בדרך כלל לא יציב בפני עצמו, בניגוד לתחום. דומיין הוא מבנה יציב באופן עצמאי של חלבון. לכן, זה יכול להיות מולקולת חלבון חלקית או שלמה. זוהי יחידה תפקודית יסודית תלת מימדית של החלבון. יתר על כן, יש לה פונקציה, והיא יחידה עצמאית.מוטיב יכול להיות חלק מהדומיין. אבל תחום לא יכול להיות חלק ממטיב. זה ההבדל בין מוטיב לתחום.
