ההבדל העיקרי בין אוליגופפטיד לפוליפפטיד הוא שאוליגופפטידים מכילים מעט שאריות חומצות אמינו, בעוד שפוליפפטידים מכילים מספר רב של שאריות חומצות אמינו.
המונחים אוליגופפטידים ופוליפפטידים נכנסים לקטגוריה של חלבונים. פפטידים הם שרשראות קצרות של חומצות אמינו. חומצות אמינו נקשרות זו לזו באמצעות קשרים פפטידים. לכן, אנו יכולים לסווג את הפפטידים הללו לפי מספר חומצות האמינו הקיימות בפפטידים אלה. למשל, דיפפטידים, טריפפטידים, טטרפפטידים, אוליגופפטידים ופוליפפטידים.
מהו אוליגופפטיד?
אוליגופפטיד הוא שרשרת של חומצות אמינו המכילות מספר קטן של חומצות אמינו לכל מולקולה.לעתים קרובות אנו קוראים למולקולות הללו "פפטידים", כמונח כללי. מספר שאריות חומצות האמינו הקיימות במולקולות הפפטידים הללו יכול לנוע בין שתיים לעשרים חומצות אמינו. אוליגופפטידים יכולים לכלול גם כמה צורות פפטידים קטנות כגון דיפפטידים, טריפפטידים וכו'. כמה דוגמאות נפוצות לאוליגופפטידים המופיעים באופן טבעי כוללות מיקרוווירידין, ציאנופטולינים, מיקרוציסטינים וכו'.
איור 01: מבנה של טריפפטיד
אוליגופפטידים אלו מיוצרים על ידי סינתאזות של פפטידים לא ריבוזומים או NRPS. אבל יש כמה יוצאי דופן. לדוגמה, ציקלאמידים ומיקרוווירידין מסונתזים דרך מסלולים ריבוזומיים. תהליך הבידוד של אוליגופפטידים כולל העשרת אוליגופפטידים, טיהור וזיהוי. לתהליך הזיהוי נוכל להשתמש בכרומטוגרפיה ג'ל, HPLC, HPLC-ספקטרוסקופיה מסה, כרומטוגרפיה של חילופי יונים וכו'.
מהו פוליפפטיד
פוליפפטיד הוא שרשרת של שאריות חומצות אמינו המכילות מספר רב של חומצות אמינו. חלבון מכיל שרשרת פוליפפטיד אחת או יותר. בשרשראות הפוליפפטידיות הללו, חומצות האמינו מקושרות זו לזו באמצעות קשרים פפטידים, שהם סוג של קשרים כימיים קוולנטיים. כל שרשרת פוליפפטידית מכילה שני טרמינלים: N-terminal ו-C-terminal. ה-N-טרמינל הוא האמינו-טרמינל, המסתיים בקבוצת אמינו חופשית, ואילו ה-C-טרמינל הוא ה-Carboxyl-טרמינל המסתיים בקבוצת קרבוקסיל חופשית. רצף חומצות האמינו הקיימות בפפטיד נקבע על ידי הקודונים ב-mRNA המעורבים בייצור הפוליפפטיד או החלבון באמצעות תרגום גדיל התבנית.
בהתאם למספר וסידור הפוליפפטידים בחלבון, ישנם ארבעה סוגים עיקריים של מבני חלבון כדלקמן:
- מבנה ראשוני – המבנה הראשוני של חלבון מכיל שרשרת פוליפפטידית אחת שיש לה גשרים דיסולפידיים בין כמה חומצות אמינו באותה שרשרת, מה שיוצר מבנה מקופל.
- מבנה משני – למבנה המשני של חלבון יש שתי צורות עיקריות: מבנה אלפא-סליל ומבנה גיליון ביתא.
איור 02: מבנה סליל אלפא
- מבנה שלישוני – זהו מבנה רשת מקופל מאוד. מבנה זה חשוב מאוד כי הוא קובע את התפקוד של חלבון.
- מבנה רבעוני – זהו מבנה מורכב מאוד של שתיים או שלוש שרשראות פוליפפטידים המקושרות זו לזו.
מה ההבדל בין אוליגופפטיד לפוליפפטיד?
אוליגופפטידים ופוליפפטידים הם שתי קטגוריות שונות של חלבונים. הם נבדלים זה מזה בהתאם למספר שאריות חומצות האמינו הקיימות במולקולות החלבון.לכן, ההבדל העיקרי בין אוליגופפטיד לפוליפפטיד הוא שהאוליגופפטידים מכילים מעט שאריות חומצות אמינו, בעוד שפוליפפטידים מכילים מספר רב של שאריות חומצות אמינו.
האינפוגרפיה שלהלן מסכמת את ההבדל בין אוליגופפטיד לפוליפפטיד.
סיכום – אוליגופפטיד לעומת פוליפפטיד
אוליגופפטידים ופוליפפטידים הם שתי קטגוריות שונות של חלבונים. הם נבדלים זה מזה, בהתאם למספר שאריות חומצות האמינו הקיימות במולקולות החלבון הללו. כלומר, ההבדל העיקרי בין אוליגופפטיד לפוליפפטיד הוא שאוליגופפטידים מכילים מעט שאריות חומצות אמינו, בעוד שפוליפפטידים מכילים מספר רב של שאריות חומצות אמינו.
