ההבדל העיקרי בין ORF לאקסון הוא שה-ORF או מסגרת הקריאה הפתוחה הם קטע של רצף DNA שמתחיל באתר התחלת התרגום (קודון התחלה) ומסתיים באתר סיום התרגום (קודון עצירה) בעוד שהאקסון הוא רצף נוקלאוטידים בתוך גן המקודד לחומצות אמינו.
מסגרת קריאה פתוחה היא חלק ממסגרת קריאה. מסגרות קריאה נקראות על ידי ריבוזומים על מנת ליצור חלבונים. ORF הוא מתיחה רציפה של קודונים המעניקה חלבון מתפקד במלואו. זה מתחיל בקודון התחלה ומסתיים בקודון עצירה. בתוך ה-ORF, אין קודון עצירה שמפריע לרצף הקידוד.התרגום מתחיל בקודון התחלה ומסתיים בקודון עצירה. אקסון הוא רצף נוקלאוטידים של גן. הוא מקודד לחומצות אמינו של החלבון. לכן, אקסונים הם אזורים מקודדים של גן.
מהו ORF?
מסגרת קריאה פתוחה או ORF היא המתיחה המתמשכת של רצף נוקלאוטידים שמתחיל בקודון התחלה ומסתיים בקודון עצירה. במילים פשוטות, ORF מתייחס לאזור של רצף הנוקלאוטידים הממוקם בין קודוני ההתחלה והעצירה. בין לבין, אין קודון עצירה שמפריע ל-ORF. רצף הנוקלאוטידים בין קודון התחלה לעצירה מקודד לחומצות אמינו. בדרך כלל, קודון התחלה הוא ATG בעוד שקודוני עצירה הם TAG, TAA ו-TGA. ORF נותן חלבון פונקציונלי בעת שעתוק ותרגום. לכן, ORF כולל קודון התחלה, מספר קודונים באזור האמצע וקודון עצירה. מעניין, ל-ORF יש אורך שניתן לחלק בשלוש.
איור 01: ORF
בפרוקריוטים, מכיוון שאין אינטרונים, ORF הוא האזור המקודד של גן שמתעתק ישירות ל-mRNA. באאוקריוטים, מכיוון שיש אינטרונים, ORF הוא רצף הקודון שנוצר לאחר עיבוד או שחבור RNA. ORF היא עדות המסייעת לחיזוי גנים מאחר ש-ORF ארוכים עשויים להיות חלק מהגן.
מה זה אקסון?
אקסונים הם רצפי הנוקלאוטידים המקודדים של גנים שמתורגמים לחלבונים. הם נמצאים משני הצדדים של אינטרון. לאחר הסרת רצפים שאינם מקודדים מה-mRNA הקדם, מולקולת ה-mRNA הבשלה מורכבת רק מרצפי אקסון. אז רצף הנוקלאוטידים של מולקולת ה-RNA הסופית (mRNA בוגר) הופך לרצף חומצות אמינו של חלבון ספציפי.
איור 02: Exons
כמעט לכל הגנים יש רצף נוקלאוטידים ראשוני המבדיל אותו כגן מגדיל ה-DNA או ה-RNA הראשי, הידוע כ-Open Reading Frame (ORF. בגנים מסוימים, שני ORFs מסמנים את כל הגן והאקסונים ממוקמים בתוך רצף הקידוד. למרות שנשמע שאקסונים מתבטאים תמיד בגנים, ישנם מקרים שבהם רצפי אינטרונים מתערבים באקסון כדי לגרום למוטציות, ותהליך זה ידוע כאקסוניזציה.
מהם הדמיון בין ORF ל-Exon?
- הן ORF והן האקסון הם רצפי נוקלאוטידים.
- Long ORF ואקסונים הם חלקים של גן.
- לשניהם יש רצפי קידוד.
מה ההבדל בין ORF ל-Exon?
ORF ואקסון הם רצפי נוקלאוטידים. ORF מתייחס לכל מתיחה של רצף DNA הממוקם בין קודון התחלה לקודון עצירה.לעומת זאת, האקסון הוא רצף נוקלאוטידים מקודד של גן המקודד לחומצות אמינו. לפיכך, זהו ההבדל העיקרי בין ORF לאקסון. אקסונים הם חלקים מגן בעוד ש-ORF ארוך צפוי להיות חלק מגן. יתר על כן, ישנם אינטרונים בשני הצדדים של אקסון בעוד ש-ORF אינו כולל אינטרונים.
להלן אינפוגרפיקה מסכמת את ההבדל בין ORF ל-exon בצורה טבלה.
סיכום – ORF נגד Exon
מסגרת הקריאה הפתוחה (ORF) היא חלק ממסגרת הקריאה. זוהי המתיחה המתמשכת של רצף ה-DNA שמתחילה בקודון התחלה ומסתיימת בקודון עצירה. אקסון הוא רצף נוקלאוטידים של גן. הוא מקודד לחלק מרצף ה-mRNA. לכן, אקסונים הם חלקים מרצף הגנים שמתבטאים בחלבון.לפיכך, זה מסכם את ההבדל בין ORF ל-exon.
