ההבדל העיקרי בין PFGE ל-CRP הוא ש-PFGE היא טכניקת מעבדה המשמשת להפרדה של מולקולות DNA גדולות על ידי הפעלת שדה חשמלי שמשתנה מעת לעת, בעוד שניתוח CRP (c-reactive protein) הוא טכניקה ש מזהה חלבון בצורת טבעת בפלזמה בדם.
ניתוח PFGE ו-CRP הן שתי טכניקות המשמשות מדענים כדי לזהות אורגניזמים פתוגניים שונים הגורמים נזקים לגוף האדם. Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) היא טכניקת מעבדה ישירה המזהה טביעת אצבע של DNA של פתוגן, במיוחד בידוד חיידקי. CRP, לעומת זאת, היא בדיקה עקיפה המשמשת לזיהוי חלבון ספציפי בדם שנבע מדלקת.דלקות אלו נובעות בדרך כלל מזיהומים של חיידקים או פתוגנים אחרים.
מה זה PFGE?
אלקטרופורזה של ג'ל בשדה פועם היא טכניקה המשמשת להפרדה של מולקולות DNA גדולות במטריצת ג'ל על ידי הפעלת שדה חשמלי. השדה החשמלי משנה את כיוונו מעת לעת. זה עשוי לשמש להנדסה גנטית או גנוטיפ של אורגניזמים שונים. ההליך של PFGE דומה יחסית לטכניקת האלקטרופורזה הסטנדרטית של ג'ל. ההבדל היחיד הוא המתח שמשתנה מעת לעת בין שלושה כיוונים. כיוון אחד עובר בציר המרכזי של הג'ל בעוד שני האחרים פועלים בזווית של 60 מעלות משני הצדדים. מכיוון שזמן הדופק שווה לכל כיוון, הדבר גורם להגירה נטו קדימה של DNA.
איור 01: ניתוח PFGE
הליך זה נמשך זמן רב יותר מאלקטרופורזה כללית של ג'ל, בשל גודל השברים הנפתרים. בטכניקת PFGE, עם השינויים בכיוון השדה החשמלי, אורכים שונים של DNA מגיבים לשינויים בקצבים שונים. שברי DNA גדולים מיושרים מחדש לאט בהשוואה לשברי DNA קטנים יותר שמתיישרים מחדש במהירות. לכן, הפרדה טובה יותר של שברי DNA אפשרית באמצעות טכניקה זו.
PFGE משמש בדרך כלל לאיתור פתוגנים חיידקיים כגון Listeria monocytogenes. זוהי שיטה פופולרית לזיהוי זיהומים קליניים.
מהו ניתוח CRP?
C-reactive protein (CRP) הוא חלבון פנטאמרי טבעתי (בצורת טבעת) שנמצא בפלזמה בדם. בדרך כלל, CRP עולה בריכוזים בתגובה לדלקת. ניתוח CRP מבוסס על זיהוי של חלבון זה בפלזמה בדם. חלבון CRP מסונתז על ידי הכבד בתגובה לגורמים מסוימים המופרשים על ידי מקרופאגים ותאי שומנים.חלבון CRP הוא הקולטן המזהה דפוסים (PRR) הראשון שזוהה.
איור 02: ניתוח CRP
ניתן להבחין ברמת חלבון מוגברת של CRP לאחר טראומה, התקף לב, הפרעות אוטואימוניות וזיהומים חיידקיים כגון אלח דם. רמת החלבון התקינה של CRP בפלסמת הדם היא 0.3-10 מיליגרם לליטר (מ"ג/ליטר). הדם נשאב מוריד, בדרך כלל מזרועו של המטופל. הניתוח מתבצע באמצעות הליך מדידה ביוכימי. בתוצאה של בדיקת CRP, רמות CRP גבוהות מ-10 מ"ג/ליטר הן סימן לזיהום חמור (אלח דם). בדיקת CRP אינה מסבירה את המיקום או הגורם לדלקת. לכן, הרופאים צריכים להמליץ על בדיקות נוספות כדי להסביר את הגורם לדלקת. לפעמים, רמת חלבון CRP עולה עקב עישון, השמנת יתר ומחסור בפעילות גופנית.
מהם הדמיון בין ניתוח PFGE ו-CRP?
- ניתוח PFGE ו-CRP הם נהלי בדיקה המשמשים במעבדות.
- שני הבדיקות מכוונות לביומולקולות.
- הם משמשים לאיתור מחלות אנושיות.
- בדיקות אלו מסוגלות לזהות פתוגנים.
מה ההבדל בין ניתוח PFGE ו-CRP?
PFGE היא טכניקת מעבדה המשמשת להפרדה של מולקולות DNA גדולות על ידי הפעלת שדה חשמלי המשתנה מעת לעת. לעומת זאת, ניתוח CRP הוא טכניקה המזהה חלבונים בצורת טבעת בפלסמה בדם. לפיכך, זהו ההבדל העיקרי בין ניתוח PFGE ו-CRP. יתרה מכך, PFGE מזהה פתוגנים באופן ישיר, בעוד שניתוח CRP מזהה פתוגנים באופן עקיף.
להלן רשימה של הבדלים חשובים בין ניתוח PFGE ו-CRP בצורת טבלה.
סיכום – ניתוח PFGE לעומת CRP
ניתוח PFGE ו-CRP הן שתי בדיקות בשימוש שגרתי במעבדות קליניות. PFGE היא טכניקת מעבדה המשמשת מדענים לייצור טביעות אצבע של DNA, במיוחד פתוגנים חיידקיים. בדיקת C-reactive protein (CRP) משמשת לאיתור דלקת על ידי זיהוי חלבון c-reactive מוגבר בפלסמת הדם. שתי הבדיקות חשובות לאיתור מחלות אנושיות. לפיכך, זה מסכם את ההבדל בין ניתוח PFGE ו-CRP.
