ההבדל העיקרי בין Shine Dalgarno לרצף Kozak הוא שרצף Shine Dalgarno הוא אתר קישור ריבוזומלי ב-RNA שליח חיידקי וארכיאלי, בעוד שרצף Kozak הוא אתר התחלת תרגום חלבון ברוב ה-RNAs שליח האוקריוטי.
רצף Shine Dalgarno ו-Kozak הם שני רצפי קונצנזוס שחשובים מאוד לתחילת התרגום. בביולוגיה מולקולרית, תרגום הוא התהליך שבו ריבוזומים בציטופלזמה מסנתזים חלבונים לאחר תהליך השעתוק. בתרגום, mRNA (RNA שליח) מפוענח בריבוזום כדי לייצר שרשרת חומצות אמינו ספציפית מחוץ לגרעין.בדרך כלל, ריבוזום גורם לתהליך הפענוח על ידי הקלת הקישור של רצפי נוגדי tRNA משלימים לקודוני mRNA. התרגום מתקדם בשלושה שלבים: התחלה, התארכות וסיום.
מה זה Shine Dalgarno Sequence?
רצף Shine Dalgarno הוא אתר קישור ריבוזומלי ב-RNA שליח חיידקי וארכיאלי. הוא ממוקם בדרך כלל בסביבות 8 בסיסים במעלה הזרם של קודון ההתחלה AUG. רצף RNA זה עוזר בגיוס ריבוזומים ל-RNA שליח על ידי יישור הריבוזום עם קודון התחלה mRNA. לפיכך, הוא יוזם סינתזת חלבון. לאחר הגיוס, ה-tRNA יכול להוסיף חומצות אמינו ברצף כפי שהוכתב על ידי קודוני ה-mRNA. רצף מיוחד זה נפוץ בחיידקים אך נדיר יותר בארכיאה. יתר על כן, הוא קיים גם בתמלילים של כלורופלסט ומיטוכונדריה. רצף Shine Dalgarno הוצע לראשונה על ידי המדענים האוסטרלים ג'ון שיין ולין Dalgarno. רצף הקונצנזוס של שישה בסיסים הוא AGGAGG. לדוגמה, ב-Escherichia coli הרצף הוא AGGAGGU.
איור 01: Shine Dalgarno Sequence
בחירת אתר ההתחלה (AUG) תלויה באינטראקציה בין תת-יחידת ה-30S של הריבוזום ותבנית mRNA. האזור העשיר בפירמידין ברכיב 16srRNA של תת-יחידת 30S נקשר לאזור העשיר בפורין המכונה רצף Shine Dalgarno במעלה הזרם של קודון ההתחלה של AUG ב-mRNA. יתרה מזאת, במהלך היווצרות קומפלקס ההתחלה, רצפי נוקלאוטידים משלימים אלו מזדווגים ליצירת מבנה RNA דו-גדילי. זה מקל על הקישור של mRNA לריבוזום בצורה כזו שקודון ההתחלה ממוקם באתר P של הריבוזום.
מהו רצף קוזאק?
רצף Kozak הוא אתר התחלת תרגום חלבון ברוב ה-mRNA האיקריוטי.רצף זה נקרא גם רצף הקונצנזוס של קוזאק. רצף קוזאק הוא הרצף האופטימלי לתחילת תרגום באוקריוטים. רצף זה הוא היבט אינטגרלי של ויסות חלבון. זה גם חשוב מאוד לבריאות התא הכללית. זה עוזר לתקן תרגום חלבונים ממסרים גנטיים על ידי תיווך הרכבה של ריבוזומים ותחילת תרגום.
איור 02: רצף קוזאק
רצף זה נקרא על שם המדען שגילה אותו, מרילין קוזאק. היא גילתה את זה באמצעות ניתוח מפורט של רצפים גנומיים של DNA. רצף Kozak הוא 5' (gcc) gccRccAUGG-3'. האותיות הגדולות מציינות בסיסים שמורים, ואילו אותיות קטנות מציינות בסיסים משתנים נפוצים. R מציין פורין (אדנין או גואנין) שנמצא תמיד במיקום זה.
מהם הדמיון בין Shine Dalgarno ו-Kozak Sequence?
- רצף Shine Dalgarno ו-Kozak הם שני רצפי קונצנזוס שחשובים מאוד בתחילת התרגום.
- שניהם רצפי RNA.
- תת-היחידה הקטנה יותר של הריבוזום נקשרת לשני הרצפים.
- שני הרצפים מתווכים את הרכבת הריבוזום הנכונה ואת התחלת התרגום.
- הם היבטים אינטגרליים של ויסות חלבון ובריאות התא הכללית.
מה ההבדל בין Shine Dalgarno ו-Kozak Sequence?
רצף Shine Dalgarno הוא אתר קישור ריבוזומלי המצוי ב-RNA שליח חיידקי וארכיאלי, בעוד שרצף Kozak הוא אתר התחלת תרגום חלבון שנמצא ברוב ה-RNA שליח האוקריוטי. אז זה ההבדל העיקרי בין Shine Dalgarno לרצף Kozak. יתר על כן, רצף Shine Dalgarno הוא 5'AGGAGGU3' בעוד שרצף Kozak הוא 5' (gcc) gccRccAUGG-3'.
האינפוגרפיקה הבאה מפרטת את ההבדלים בין רצף Shine Dalgarno ו-Kozak בצורה טבלה להשוואה זה לצד זה.
סיכום – Shine Dalgarno נגד Kozak Sequence
רצפי Shine Dalgarno ו-Kozak הם שני רצפי RNA קונצנזוס שחשובים מאוד להרכבת הריבוזומים ותחילת התרגום. רצף Shine Dalgarno הוא אתר קישור ריבוזומלי ב-RNA שליח חיידקי וארכיאלי, בעוד שרצף Kozak הוא אתר התחלה של תרגום חלבון ברוב ה-RNA שליח האוקריוטי. לפיכך, זה מסכם את ההבדל בין Shine Dalgarno ורצף Kozak.
