ההבדל העיקרי בין ferredoxin ו-Rubredoxin הוא שלפרדוקסין יש פוטנציאל חיזור נמוך במידה ניכרת בהשוואה לרוברדוקסין.
גם ferredoxin וגם Rubredoxin הם חלבונים המכילים ברזל. עם זאת, אנו יכולים למצוא פרדוקסין בצורות חיידקיות ובצמחים מכיוון שהוא חלבון כלורופלסט. עם זאת, רוברדוקסין הוא חלבון המופיע רק בחיידקים וארכיאה. לשתי התרכובות הללו מבנה דומה.
מה זה Ferredoxin?
Ferredoxin הוא חלבון המכיל ברזל-גופרית. הוא מעורב בתיווך העברת האלקטרונים במגוון תגובות מטבוליות.אלו חלבונים קטנים המסיסים במים, והם קיימים בכלורופלסטים. אטומי הברזל והגופרית בחלבון זה מסודרים בצברי ברזל-גופרית. הם יכולים לפעול כקבלים ביולוגיים על ידי קבלה ופריקה של אלקטרונים. כאן, מצב החמצון של אטומי ברזל משתנה מ-+2 ל-+3. לכן, הם פועלים כסוכני העברת אלקטרונים בתגובות חיזור המתרחשות בסביבה ביולוגית. באופן השוואתי, פוטנציאל החיזור של חלבון זה נמוך. מולקולת חלבון פרדוקסין יכולה להכיל שניים, שלושה או ארבעה אטומי ברזל לכל מולקולת חלבון. ישנם שלושה סוגים נפוצים של ferredoxins: Fe2S2 ferredoxins, Fe4S 4 ferredoxins ו-Fe3S4 ferredoxins.
התפקיד העיקרי של הפרדוקסין הוא להקצות אלקטרונים באנרגיה גבוהה בכלורופלסט, וחלבונים אלו מעורבים בהפצת אלקטרונים הנדרשים לקיבוע פחמן דו חמצני, הפחתת ניטריל, הפחתת סולפיט, סינתזת גלוטמט, זרימת אלקטרונים מחזורית וכו'.
מהו Rubredoxin?
Rubredoxin הוא חלבון המכיל ברזל שניתן למצוא בחיידקים ובארכאים. זהו סוג של חלבון בעל משקל מולקולרי נמוך (בדרך כלל חלבונים הם תרכובות בעלות משקל מולקולרי גבוה). עם זאת, בניגוד לפרדוקסין, חלבון Rubredoxin אינו מכיל סולפידים אנאורגניים. התפקיד העיקרי של רוברדוקסין הוא בכך שהוא משתתף במנגנוני העברת אלקטרונים בתגובות חיזור המתרחשות במערכות ביולוגיות.
כאשר בוחנים את המבנה של Rubredoxin, הוא מכיל אטום ברזל מרכזי שיש לו גיאומטריה טטרהדרלית כמעט. ארבע הקבוצות הקשורות לאטום ברזל זה הן שאריות ציסטאין. רוב חלבוני ה-Rubredoxin הם מינים כימיים מסיסים במים. עם זאת, ישנם כמה מינים בלתי מסיסים הקיימים כחלבונים הקשורים לממברנה.לְמָשָׁל. Rubredoxin-A.
במהלך מנגנון העברת האלקטרונים, מצב החמצון של אטום הברזל המרכזי משתנה מ-+2 ל-+3. אנו יכולים לזהות בקלות את השינוי הזה במצב החמצון מכיוון שהצבע משתנה מאדום לחסר צבע. במהלך השינוי הזה, יון המתכת נשאר במצב ספין גבוה מכיוון שהוא מועיל למזער את השינויים המבניים של החלבון. בדרך כלל, פוטנציאל ההפחתה של רוברדוקסין גבוה יותר מפרדוקסין; הוא בטווח של +50 mV עד -50 mV.
מה ההבדל בין Ferredoxin ל-Rubredoxin?
Ferredoxin ו-Rubredoxin הם תרכובות חלבון המכילות ברזל וגופרית כרכיבים. ההבדל העיקרי בין ferredoxin ו-Rubredoxin הוא שלפרודוקסין יש פוטנציאל חיזור נמוך משמעותית בהשוואה לרובדוקסין. פוטנציאל החיזור של ferredoxin הוא כ-420 mV, ופוטנציאל החיזור של Rubredoxin נע בין -50 ל-+50 mV. יתר על כן, ferredoxin יכול להכיל שניים, שלושה או ארבעה אטומי ברזל לכל מולקולת חלבון, אבל ברובדוקסין, יש אטום ברזל מרכזי אחד.עם זאת, לשתי המולקולות הללו יש גיאומטריה טטרהדרלית דומה מאוד סביב אטומי הברזל.
יתר על כן, ferredoxin מכיל גופרית אנאורגנית כמרכיב במולקולת החלבון, אך אין גופרית אנאורגנית ברוברדוקסין. כאשר בוחנים את ההתרחשות, פרדוקסין יכול להופיע הן בצורות חיידקים והן בצמחים, אך רוברדוקסין מופיע בחיידקים ובארכאות.
הטבלה למטה מסכמת את ההבדל בין ferredoxin ו-Rubredoxin.
סיכום – Ferredoxin לעומת Rubredoxin
Ferredoxin ו-Rubredoxin הם תרכובות חלבון המכילות ברזל וגופרית כרכיבים. ההבדל העיקרי בין ferredoxin ו-Rubredoxin הוא שלפרדוקסין יש פוטנציאל חיזור נמוך במידה ניכרת בהשוואה לרוברדוקסין.
