ההבדל העיקרי בין גן מועמד ל-GWAS הוא שגישת הגנים המועמדים חוקרת את השונות הגנטית בתוך מספר קטן של גנים מוגדרים מראש של עניין, בעוד ש-GWAS חוקר את כל הגנום עבור וריאציה גנטית נפוצה מאחורי מצב מחלה מסוים.
גישת גנים מועמדים ומחקרי אסוציאציות גנום-רחביות (GWAS) הן שתי שיטות שחשובות לאיתור רגישות גנטית למחלות. גישת הגנים המועמדים מבוססת על מספר קטן של גנים שצוין מראש בעוד ש-GWAS מבוסס על בדיקת הגנום כולו. מכאן שגישת הגנים המועמדים דורשת ידע מוקדם של גנים עם רלוונטיות למחלה, בניגוד ל-GWAS.
מהו ג'ין המועמד?
גישת הגנים המועמדים היא אחת הטכניקות החוקרות את הקשר בין שונות גנטית בתוך גנים מוגדרים מראש לעניין לבין פנוטיפים או מצבי מחלה. בגישה זו, יש צורך בידע מוקדם על ההשפעה התפקודית הביולוגית של הגן על התכונה או המחלה המדוברת. בהתבסס על ידע זה, מספר קטן של גנים נבחר ומנתח עבור שונות גנטית.
איור 01: גישה ג'נית למועמד
בחירת הגנים נעשית על סמך הרלוונטיות הביולוגית, הפיזיולוגית והתפקודית למחלה הנדונה בגישה זו. גישה זו מתוכננת לעתים קרובות כמחקר מקרה-ביקורת.
מה זה GWAS?
GWAS ראשי תיבות של Genome-Wide Association Study.זה מתייחס גם למחקרי אסוציאציות של גנום שלם. מחקרים אלו מתמקדים בעיקר במחקרי תצפית. הם מנתחים את הווריאציות הגנטיות של פרטים שונים הקשורים בדרך כלל לתכונה ספציפית. הגנום כולו חשוב לניתוח GWAS.
GWAS הוא כלי חשוב בניתוח של פולימורפיזם נוקלאוטיד בודד הקשור למצבי מחלה שונים. זהו מחקר השוואתי של פולימורפיזמים שונים של נוקלאוטידים בודדים על פני אוכלוסייה רחבה. מדגם המחקר של GWAS גבוה מאוד; לפיכך, הוא מקבל גם פורמט של מחקר עוקבה רוחב.
איור 02: GWAS
מחקר GWAS הראשון התקיים בהתייחס לאוטם שריר הלב וניתוח הגנים הקשורים לאוטם שריר הלב. כיום, GWAS ממלא תפקיד חשוב בקביעת הרקע הגנטי של מחלות מורכבות עם אטיולוגיה לא ידועה.
מה הם קווי הדמיון בין גן המועמד ל-GWAS?
- הן גישת הגנים המועמדים והן GWAS הן טכניקות המנתחות את הקשר הגנטי בין הגנוטיפ והפנוטיפ של המחלה.
- שתי הגישות עוזרות להבין את הבסיס הגנטי של רגישות למחלות.
מה ההבדל בין גן מועמד ל-GWAS?
גישת הגנים המועמדים מבוססת על הגנים המועמדים או הגנים שצוינו מראש, בעוד ש-GWAS מבוסס על הגנום כולו. אז זה ההבדל העיקרי בין גן מועמד ל-GWAS. כמו כן, בגישת הגנים המועמדים, בחירת הגנים נחוצה בעוד שאין צורך בה ב-GWAS.
יתר על כן, גישת גנים מועמדים דורשת ידע מוקדם על הגנים הרלוונטיים למחלה, בעוד שאין צורך ב-GWAS.
להלן אינפוגרפיקה מספקת השוואה מפורטת יותר הקשורה להבדל בין גן מועמד ל-GWAS.
סיכום – ג'ין המועמד מול GWAS
גן מועמד ו-GWAS הם שני מחקרים הקשורים לגנים. גישת הגנים המועמדים מתמקדת בשונות הגנטית הקשורה למחלה בתוך מספר קטן של גנים שצוינו מראש. לעומת זאת, GWAS חוקר את השונות הגנטית הקשורה למחלה בתוך הגנום כולו. אז זה ההבדל העיקרי בין גן מועמד ל-GWAS. שתי השיטות חשובות בהבנת הבסיס הגנטי של רגישות למחלות.
