ההבדל העיקרי בין MLVA ל-MLST הוא ש-MLVA משתמש בפולימורפיזם של רצפי DNA שחוזרים על עצמם במקביל כדי לאפיין מינים מיקרוביאליים, בעוד ש-MLST משתמש בפולימורפיזם של רצפי DNA של שברים פנימיים של מספר גנים של משק בית כדי לאפיין מינים מיקרוביאליים.
הקלדה מיקרוביאלית משמשת בדרך כלל כדי לקבוע את המקור והנתיבים של זיהומים. זה מאשר או שולל התפרצויות. הקלדת חיידקים מתחקה גם אחר העברה צולבת של פתוגנים הקשורים לטיפול רפואי ומזהה זנים ארסיים. יתר על כן, הקלדת חיידקים מעריכה את היעילות של אמצעי בקרה של מינים מיקרוביאליים פתוגניים. MLVA ו-MLST הן שתי טכניקות ביולוגיות מולקולריות המשמשות בהקלדת חיידקים.
מה זה MLVA?
אנליזת VNTR מרובים (MLVA) היא שיטה ביולוגית מולקולרית המשתמשת בפולימורפיזם של רצפי DNA שחוזרים על עצמם במקביל כדי לאפיין מינים מיקרוביאליים. זוהי שיטה המשמשת לניתוח גנטי של מינים מיקרוביאליים מסוימים.
במהלך השלב הראשון של MLVA, כל לוקוס VNTR ממוקד מוגבר על ידי PCR עם פריימרים ספציפיים לאזור מאגפים. לאחר מכן הפרגמנטים המתקבלים מופרדים בגודל על ידי אלקטרופורזה על רצף נימי. הגנוטיפים של כל לוקוס והתוצאות שנאספו מכל דגימה מאפשרים לאפיין מיקרואורגניזם שהמין שלו ידוע. זה גם מאפשר לזהות את תת-המין באמצעות הקלדת אללים והשוואה למאגרי המידע של MLVA.
איור 01: MLVA
שיטת MLVA זו סלקטיבית יותר משיטת MLST. יתר על כן, שיטת MLVA אינה מצריכה שלב ריצוף DNA. לפיכך, הוא מאפשר להבדיל בין תת-מינים קרובים או מינים שיבוטים.
מה זה MLST?
הקלדת רצף מרובה (MLST) היא טכניקה המשתמשת בפולימורפיזם של רצפי DNA של שברים פנימיים של גנים מרובים של משק בית כדי לאפיין מינים מיקרוביאליים. MLST היא טכניקה בניתוח גנטי להקלדה של לוקוסים מרובים.
איור 02: MLST
זהו סוג של הקלדת רצף המשמשת כטכניקת התייחסות להבחין בין זנים שונים של מינים מיקרוביאליים. שיטה זו מבוססת על רצף גנים של משק בית.הגנים של משק הבית מקודדים בדרך כלל חלבונים חיוניים של גורמים מיקרוביאליים כמו חיידק. לרצפים אלה של גנים לניהול בית יש את הייחודיות של הצגת פולימורפיזם יציב לאורך זמן. לכן, ההבדלים ברצפים של גנים למשק בית מספיקים כדי להבחין בין זנים זה לזה. יתר על כן, ערכת ה-MLST הראשונה שפותחה הייתה Neisseria meningitidis, הגורם הגורם לדלקת קרום המוח של מנינגוקוק ולספטיסמיה. מאז הצגתו, נעשה שימוש ב-MLST לא רק עבור פתוגנים אנושיים אלא גם עבור פתוגנים צמחיים.
מה הם קווי הדמיון בין MLVA ל-MLST?
- MLVA ו-MLST הן שתי טכניקות ביולוגיות מולקולריות המשמשות בהקלדת חיידקים.
- ניתן להשתמש בשתי הטכניקות לניתוח פילוגנטי מיקרוביאלי.
- שתי הטכניקות מבוססות על פולימורפיזם גנטי.
- ניתן להשתמש בהם לזיהוי מחלות אנושיות הגורמות לפתוגנים מיקרוביאליים.
- יש לבצע את שתי הטכניקות על ידי ביולוגים מולקולריים מיומנים.
מה ההבדל בין MLVA ל-MLST?
MLVA היא טכניקה המשתמשת בפולימורפיזם של רצפי DNA שחוזרים על עצמם במקביל כדי לאפיין מינים מיקרוביאליים. בינתיים, MLST היא טכניקה המשתמשת בפולימורפיזם של רצפי DNA של שברים פנימיים של גנים מרובים של משק בית כדי לאפיין מינים מיקרוביאליים. לפיכך, זהו ההבדל העיקרי בין MLVA ל-MLST. יתר על כן, שיטת MLVA היא יותר סלקטיבית משיטת MLST.
האינפוגרפיה שלהלן מציגה את ההבדלים בין MLVA ל-MLST בצורה טבלה להשוואה זו לצד זו.
סיכום – MLVA לעומת MLST
MLVA ו-MLST הן שתי טכניקות ביולוגיות מולקולריות המשמשות בהקלדת חיידקים. MLVA משתמש בפולימורפיזם של רצפי DNA שחוזרים על עצמם במקביל כדי לאפיין מינים מיקרוביאליים, בעוד ש-MLST משתמש בפולימורפיזם של רצפי DNA של שברים פנימיים של מספר גנים של משק בית כדי לאפיין מינים מיקרוביאליים.אז זה ההבדל העיקרי בין MLVA ל-MLST.
