ההבדל העיקרי בין טרנספוזיציה רפליקטיבית לבין טרנספוזיציה של גזירה והדבקה הוא שבטרנספוזיציה רפליקטיבית, הטרנספוזון מועתק למיקום חדש, בעוד שבטרנספוזיציה של גזירה והדבקה, הטרנספוזון מועבר למיקום חדש.
אלמנטים הניתנים להעברה או גנים קופצים הם רצפי DNA שיכולים לשנות את מיקומם בתוך הגנום. זה מכונה טרנספוזיציה. טרנספוזיציה יכולה לפעמים ליצור או להפוך מוטציות, ולשנות את הזהות הגנטית של התא ואת גודל הגנום. הטרנספוזיציה התגלתה על ידי ברברה מקלינטוק בשנת 1983. הטרנספוזיציה יכולה להתרחש באמצעות שתי טכניקות כמו שכפול וגזירה והדבקה.
מה זה טרנספוזיציה רפליקטיבית?
טרנספוזיציה רפליקטיבית היא סוג של מנגנון טרנספוזיציה המסייע לכריתת טרנספוזון מהמיקום המקומי לאחר באמצעות טכניקה משוכפלת או משוכפלת. מנגנון זה נמצא לראשונה על ידי ג'יימס א' שפירו בשנת 1979. במנגנון זה, האלמנט הניתן להעברה משוכפל במהלך תגובת ההמרה, כך שהישות המשמרת היא העתק של האלמנט המקורי. יתרה מכך, במנגנון זה, רצפי ה-DNA התורם והקולטן יוצרים תצורת "תטא" ביניים אופיינית הנקראת Shapiro intermediate (קוינטגרט). טרנספוזיציה רפליקטיבית היא רטרוטרנספוזון אופייני. מנגנון זה מתרחש בדרך כלל בטרנספוזונים מסוג I.
איור 01: טרנספוזיציה רפליקטיבית
ניתן לראות דוגמה טובה לטרנספוזיציה רפליקטיבית בטרנספוזון E. coli TN3. טרנספוזון TN3 יכול לעבור מהפלסמיד המקורי לפלסמיד מטרה אחר באמצעות טכניקה משוכפלת או משוכפלת. כל האירוע הזה מתווך על ידי שני אנזימים חשובים הנקראים טרנספוזאז ורזולוזה. יתר על כן, ניתן לראות טרנספוזיציה רפליקטיבית הן בטרנספוזונים של DNA והן ברטרופוזונים. הנגיף החיידקי הנחקר הטוב ביותר הוא הבקטריופאג Mu.
מה זה Transposition Cut and Paste?
Cut and paste transposition הוא סוג של מנגנון טרנספוזיציה המסייע לכריתת טרנספוזון מהמיקום המקומי למקום אחר באמצעות טכניקת החיתוך והדבק. מנגנון זה ידוע גם בתור המודל השמרני של טרנספוזיציה. בטרנספוזיציה הלא-רפליקטיבית הזו, הכריתה והשילוב של טרנספוזון ממיקום גנומי אחד לאחר מתרחשים מבלי להשאיר עותק מאחור.
איור 02: גזור והדבק טרנספוזיציה
במנגנון זה, אנזים הטרנספוזאז נקשר תחילה לחזרות הסופיות שנמצאות בדרך כלל בשני קצוות הטרנספוזונים ולאחר מכן הוא יוצר מבנה הנקרא קומפלקס סינפטי (טרנספוזוזום). הקומפלקס הסינפטי מבקע את הטרנספוזון מהמיקום הגנומי המקורי שלו ומשלב אותו במיקום המטרה החדש. לאחר מכן, טרנספוזות יוצאות משני קצוות הטרנספוזון. ברגע שהאנזים הטרנספוזז עוזב את הטרנספוזון, הרווחים מתמלאים על ידי האנזים הפולימראז המארח. זה מאפשר הצטרפות מלאה של הטרנספוזון למיקום הגנומי החדש. מנגנון זה מתרחש בדרך כלל בטרנספוזונים מסוג II. יתר על כן, טרנספוזונים של חיידקים TN5 הם דוגמה ידועה שמראה מנגנון טרנספוזיציה שמרני או לחתוך והדבק.
מהם הדמיון בין טרנספוזיציה רפליקטיבית ל-Cut and Paste Transposition?
- טרנספוזיציה רפליקטיבית וגזירה והדבקה טרנספוזיציה הם שני סוגים של מנגנוני טרנספוזיציה.
- בשני המנגנונים, האלמנטים הניתנים להעברה עוברים ממיקום גנומי אחד למיקום גנומי חדש אחר.
- שני המנגנונים יכולים ליצור או להפוך מוטציות ולשנות את הזהות הגנטית של התא.
- טרנספוזונים חיידקיים מראים את שני המנגנונים.
- הם אירועים חשובים ביותר לאבולוציה.
מה ההבדל בין טרנספוזיציה רפליקטיבית ל-Cut and Paste Transposition?
טרנספוזיציה רפליקטיבית היא סוג של מנגנון טרנספוזיציה שבו הטרנספוזון מועתק למיקום חדש, בעוד ש-cut and paste transposition הוא סוג של מנגנון טרנספוזיציה שבו הטרנספוזון מועבר למקום חדש.לפיכך, זהו ההבדל העיקרי בין טרנספוזיציה רפליקטיבית לבין טרנספוזיציה של גזירה והדבקה. יתר על כן, טרנספוזיציה רפליקטיבית מתרחשת בדרך כלל בטרנספוזונים מסוג I, ואילו טרנספוזיציה של גזירה והדבקה מתרחשת בדרך כלל בטרנספוזונים בכיתה II.
האינפוגרפיקה שלהלן מציגה את ההבדלים בין טרנספוזיציה רפליקטיבית לבין גזירה והדבקה טרנספוזיציה בצורה טבלאית להשוואה זו לצד זו.
סיכום - טרנספוזיציה רפליקטיבית לעומת גזירה והדבקה טרנספוזיציה
טרנספוזיציה רפליקטיבית וגזור והדבקה הם שני סוגים של מנגנוני טרנספוזיציה. טרנספוזיציה רפליקטיבית היא סוג של מנגנון טרנספוזיציה שבו הטרנספוזון מועתק למיקום חדש, בעוד ש-cut and paste transposition הוא סוג של מנגנון טרנספוזיציה שבו הטרנספוזון מועבר למקום חדש. אז זה מסכם את ההבדל בין טרנספוזיציה רפליקטיבית לבין גזירה והדבקה טרנספוזיציה.
