ההבדל העיקרי בין FISH ל-CGH הוא ש-FISH היא טכניקה מולקולרית המזהה רצף DNA ספציפי על כרומוזום באמצעות בדיקות עם תיוג פלואורסצנטי, בעוד ש-CGH היא טכניקה ציטוגנטית מולקולרית נוספת המזהה שינויים ב-DNA הגנומי.
אנליזה ציטוגנטית ממלאת תפקיד חשוב ברפואה בעת זיהוי הפרעות כרומוזומליות כגון אנאופלואידיות, מחיקות, כפילויות וסידורים וכו'. הפרעות כרומוזומליות מובילות בסופו של דבר למחלות גנטיות כגון סרטן, אי פוריות, תסמונת דאון, תסמונת קלינפלטר, טרנר תסמונת, לוקמיה ועוד. קיימות שיטות ציטוגנטיות מולקולריות שונות לגילוי פגמים ומחלות הנ ל.ביניהם, FISH (הכלאה פלואורסצנטי באתרו) ו-CGH (הכלאה גנומית השוואתית) הן שתי טכניקות הכלאה חזקות. עם זאת, לשתי השיטות יש יתרונות וחסרונות.
מה זה FISH?
FISH היא טכניקת הכלאה של חומצות גרעין המבוצעות על חלק או קטע של רקמה, בכל הרקמה או התאים. זוהי שיטה המבוססת על בדיקה. הטכניקה תלויה בתיאוריה של זיווג בסיסים משלים של ווטסון קריק, וכתוצאה מכך DNA - הכלאיים של DNA או הכלאיים של DNA - RNA, שיכולים לזהות גנים שעברו מוטציה או לזהות את הגן המעניין. יתרה מכך, טכניקה זו משתמשת ברצפי DNA חד-גדיליים, רצפי DNA דו-גדיליים, רצפי RNA חד-גדיליים או אוליגונוקלאוטיד סינטטי שהוכן באמצעות תרגום ניק כבדיקות המשלימות לרצפי גנים בעלי עניין. חוץ מזה, התכונה החשובה ביותר של טכניקה זו היא תיוג של בדיקות עם צבעי פלואורסצנטי. כך, הבדיקות נקשרות לחלקים המשלימים של הכרומוזום ומקלים על הגילוי.
יתר על כן, FISH היא שיטה רגישה וספציפית ביותר. לפיכך, זוהי טכניקה נפוצה הן במחקר והן באבחון של ממאירות המטולוגית וגידולים מוצקים. אבל, FISH מציג רזולוציה נמוכה. זה גם דורש ידע מוקדם על חריגות המטרה כדי לתכנן רצפי בדיקה.
איור 01: FISH
ישנם יישומים רבים של FISH, בעיקר באבחון מולקולרי של מחלות זיהומיות כדי לזהות נוכחות של פתוגנים ולאשר את הפתוגן באמצעות אבחון מולקולרי. יתרה מכך, FISH היא טכניקה נפוצה בתחומי ביולוגיה התפתחותית, קריוטיפינג וניתוח פילוגנטי ומיפוי פיזי של כרומוזומים.
מה זה CGH?
הכלאה גנומית השוואתית (CGH) היא טכניקה ציטוגנטית מולקולרית מולקולרית נוספת המבוססת על DNA שיכולה לזהות את השינויים ברצפי ה-DNA הגנומי.השיטה היא שיטה מתקדמת שיכולה לנתח שינויים בכרומוזומים ובגנים כדי לזהות את השינויים או השינויים ברצפי ה-DNA הגנומי. יתר על כן, CGH דורש בידוד ופיצול של DNA מדגימת הניסוי ומדגימת ההתייחסות. לאחר מכן, יש לסמן את הדגימות באמצעות שני צבעים ניאון שונים (בדרך כלל אדום וירוק). מאוחר יותר, שתי הדגימות מעורבבות ומאפשרות הכלאה תחרותית. השלב האחרון הוא ניתוח הדגימות עבור שינויים ב-DNA כגון שכפול גנים, אובדן גנים וכו'. במיוחד, הוא מודד את ההבדלים במספר עותק ה-DNA בין דגימת הבדיקה לדגימת הביקורת.
איור 02: CGH
גרסה נוספת של CGH זמינה כעת; זוהי שיטה מתקדמת יותר מה-CGH הרגיל. זוהי טכניקה שנקראת CGH מבוסס מערך או aCGH. aCGH מאפשר זיהוי מדויק של מחיקות גנים או רצף באלפים רבים של רצפים בניסוי בודד אחד.
מהם הדמיון בין FISH ל-CGH?
- FISH ו-CGH הן שתי טכניקות מולקולריות.
- גם FISH וגם CGH מסתמכים על הכלאה של חומצות גרעין.
- כמו כן, שתי הטכניקות זקוקות לבדיקות מעוצבות כדי לזהות יעדי DNA ספציפיים.
- אנו משתמשים בהם לאבחון טרום לידתי ואחרי לידה של מחלות גנטיות.
- יתר על כן, גם FISH וגם CGH הם כלים חזקים מאוד לחקר שינויים גנומיים.
- הם משתמשים בצבעים פלורסנטים כדי לסמן בדיקות.
מה ההבדל בין FISH ל-CGH?
FISH הוא הליך הכלאה באתרו המשתמש בבדיקות ניאון כדי לזהות רצפי DNA ספציפיים, בעוד ש-CGH היא טכניקת הכלאה מולקולרית המזהה את השינויים של רצפי DNA גנומיים. אז זה ההבדל העיקרי בין FISH ל-CGH.
יתר על כן, FISH דורש ידע מוקדם על חריגות המטרה כדי לעצב רצפי בדיקה, בעוד ש-CGH אינו דורש ידע מוקדם. כמו כן, הבדל נוסף בין FISH ל-CGH הוא ש-FISH מציג רזולוציה מוגבלת ואילו aCGH מציג רזולוציה גבוהה.
האינפוגרפיקה למטה מסכמת את ההבדל בין FISH ל-CGH.
סיכום – FISH נגד CGH
FISH ו-CGH הן שתי טכניקות ציטוגנטיות מולקולריות המקלות על זיהוי רצפי גנים בעלי עניין. FISH מקל על זיהוי רצף DNA ספציפי על כרומוזום באמצעות בדיקות עם תיוג פלואורסצנטי בעוד CGH מקל על זיהוי שינויים ב-DNA הגנומי. אז זה ההבדל העיקרי בין FISH ל-CGH.
