ההבדל העיקרי בין מקטע Klenow ל-DNA פולימראז 1 הוא שמקטע Klenow הוא חלק גדול מ-DNA פולימראז 1 שחסר פעילות אקסונוקלאז של 5' עד 3' בעוד DNA פולימראז הוא אנזים של E. coli שיש לו את שלושתם דומיינים הכוללים פעילות אקסונוקלאז של 5′ עד 3′.
DNA פולימראז הוא אחד האנזימים המרכזיים המעורבים בשכפול DNA באורגניזמים חיים. ישנן צורות שונות של אנזים DNA פולימראז הנמצאים באאוקריוטים ובפרוקריוטים על סמך הגודל והצורה. DNA פולימראז 1, 2 ו-3 נמצאים רק באורגניזמים פרוקריוטים, והם ממלאים תפקידים שונים בשכפול ה-DNA.ל-DNA פולימראז 1 שלושה תחומים עם פעילות 5' עד 3' פולימראז, 3' עד 5' פעילות אקסונוקלאז ופעילות 5' עד 3' אקסונוקלאז. מקטע Klenow הוא תוצר פרוטאוליטי של DNA פולימראז 1. יש לו פעילויות 5 עד 3' פולימראז ו-3' עד 5' אקסונוקלאז של DNA פולימראז 1 שלם, אך אין לו פעילות אקסונוקלאז של 5' עד 3'.
מהו שבר קלנוב?
מקטע קלנוב הוא חלק גדול מ-DNA פולימראז 1. בניגוד ל-DNA פולימראז 1, פעילות אקסונוקלאז של 5' עד 3' אינה נראית במקטע של Klenow מכיוון שהוא חסר את תחום האקסונוקלאז קדימה של 5' עד 3'. שברי Klenow מיוצרים על ידי עיכול DNA פולימראז 1 עם פרוטאז הנקרא סובטיליזין, שהוא אנזים מעכל חלבון. ביישומים מסוימים, פעילות האקסונוקלאז של 3′ עד 5′ של מקטע Klenow הופכת לא רצויה. ניתן להסירו על ידי החדרת מוטציה בגן המקודד למקטע Klenow. האנזים המתקבל שיש לו רק את פעילות הפולימראז של 5' עד 3' ידוע בתור מקטע אקסו-קלנוב.מבחינה מורפולוגית, קטע קלנוב מזכיר את יד ימין האדם. יש לו תחום אקסונוקלאז N-טרמינלי 3'-5' ותחום פולימראז C-טרמינלי מופרד בכ-30 A.
איור 01: קטע Klenow ו-DNA Polymerase 1
קטע קלנוב הוא כלי חשוב בטכניקות ביולוגיות מולקולריות. לשברי Klenow יש שימושים מרובים. הם חשובים ביותר בשיבוט קצה קהה על מנת לייצר שברים קהים. שברי Klenow יכולים להסיר צלעות של 3' או למלא 5'' על מנת ליצור קצוות קהים. יתרה מכך, שברי Klenow משמשים לסינתזה של DNA דו-גדילי מגדילים בודדים. יתר על כן, הם משמשים להכנת בדיקות מסווגות רדיואקטיביות באמצעות פעילות פולימראז תלויה DNA ב-5' עד 3'.
מהו DNA פולימראז 1?
DNA פולימראז 1 (Pol 1) הוא אנזים המצוי בפרוקריוטים הדרוש לשכפול DNA חיידקי. זהו הסוג הראשון של פולימראז DNA שהתגלה על ידי ארתור קורנברג בשנת 1956. Pol 1 הוא הפולימראז השכיח ביותר ב-E. coli. הוא מקודד על ידי הגן polA ומורכב מ-928 חומצות אמינו. הוא מורכב משלושה תחומים. כל שלושת התחומים ממלאים פונקציות שונות. שני תחומים מבצעים פעילות 5' עד 3' אקסונוקלאז ופעילות 3' עד 5' אקסונוקלאז. בשל פעילות זו של Pol 1, הוא פופולרי כאנזים מתקן DNA ולא כאנזים משכפל DNA. לתחום השלישי יש את היכולת לזרז פילמור מרובים (5′ עד 3′) לפני שחרור ה-DNA של התבנית וחיבור שברי Okazaki יחדיו על ידי מילוי DNA חדש והסרת פריימרים של RNA.
איור 02: DNA Polymerase
Pol 1 מבודד מ-E Coli היה בשימוש נרחב ביישומים מולקולריים. עם זאת, ברגע שהתגלה ה-Tak Polymerase, הוא החליף את E Coli Pol 1 בטכנולוגיית PCR. Taq פולימראז הוא סוג של פולימראז DNA יציב תרמי ששייך ל-Pol 1.
מהם הדמיון בין קטע Klenow ל-DNA Polymerase 1?
- קטע קלנוב הוא חלק גדול של DNA פולימראז 1.
- יש להם פעילות פולימראז תלוית DNA ב-5' עד 3' ופעילות אקסונוקלאז של 3' עד 5' שמתווכת הגהה.
- הם משמשים למטרות מרובות.
מה ההבדל בין קטע Klenow ל-DNA Polymerase 1?
ההבדל העיקרי בין מקטע Klenow ל-DNA פולימראז 1 הוא שלמקטע של Klenow אין פעילות אקסונוקלאז של 5' עד 3' בעוד של-DNA פולימראז 1 יש פעילות אקסונוקלאז של 5' עד 3'. לכן, למקטע של Klenow יש שני תחומים, בעוד של-DNA פולימראז 1 יש את כל שלושת התחומים.
למטה אינפוגרפיקה מציגה פרטים נוספים על ההבדל בין מקטע Klenow ל-DNA פולימראז 1.
סיכום – מקטע Klenow vs DNA Polymerase 1
DNA פולימראז 1 הוא אנזים של E. coli שיש לו שלושה תחומים כמו תחום פילמור 5' עד 3', תחום 3' עד 5' אקסונוקלאז ו-5' עד 3' תחום אקסונוקלאז. מקטע Klenow הוא חלק גדול מפולימראז של DNA. חסר לו תחום אחד של DNA פולימראז 1, שהוא תחום האקסונוקלאז 5′ עד 3′. ההבדל העיקרי בין מקטע Klenow ל-DNA פולימראז 1 הוא שלפרגמנטים של Klenow אין תחום אקסונוקלאז של 5' עד 3' בעוד ל-DNA פולימראז 1 יש תחום אקסונוקלאז של 5' עד 3'.
