ההבדל העיקרי בין cis ו-trans splicing הוא שחבור cis הוא מנגנון תוך-מולקולרי שמסיר אינטרונים ומחבר את האקסונים שנמצאים בתוך אותו תמליל RNA, בעוד ש-trans-splicing הוא מנגנון בין-מולקולרי שמסיר אינטרונים או אאוטרונים. מצטרף לאקסונים שאינם בתוך אותו תמליל RNA.
שחבור RNA הוא סוג של עיבוד RNA לפני סינתזת חלבון. בתהליך זה, תמליל RNA טרום-שליח הופך ל-RNA שליח בוגר. RNA שליח בוגר עוזר לייצר מולקולת חלבון. במהלך שחבור RNA, האינטרונים (אזורים שאינם מקודדים) מוסרים, ואקסונים (אזורי קידוד) מחוברים יחדיו כדי ליצור mRNA בוגר.חיבור Cis וטרנס הם שני סוגים של מנגנוני שחבור RNA.
מהו Cis Splicing?
Cis splicing הוא מנגנון תוך מולקולרי שמסיר אינטרונים ומצטרף לאקסונים שנמצאים בתוך אותו תמליל RNA. שחבור cis רגיל מעבד מולקולת RNA בודדת. שחבור Cis הוא תהליך השחבור האופייני של mRNA מראש המבוצע על ידי ספליזוזומים. באינטרון, אתר תורם (קצה 5' של האינטרון), אתר סניף (ליד קצה 3' של האינטרון) ואתר מקבל (קצה 3' של האינטרון) חיוניים ביותר לחבור. אתר תורם השחוג כולל GU רצף בלתי משתנה בקצה 5' של האינטרון. לאתר מקבל החבור בקצה 3' של האינטרון יש רצף AG בלתי משתנה. במעלה הזרם מרצף ה-AG, ישנו אזור הנקרא אזור הפירימידין (דרכי הפוליפירימידין). במעלה הזרם ממערכת הפוליפירמידין, יש נקודת הסתעפות הכוללת נוקלאוטיד אדנוזין. נוקלאוטיד זה מעורב ביצירת לריאט.
איור 01: חיבור Cis and Trans Splicing
הספליזומים העיקריים הם U1, U2, U4, U5 ו-U6. ביניהם, U1 ו-U2 חשובים מאוד. ב-cis splicing, U1 נקשר לאתר השבר של 5', ו-U2 נקשר לנקודת ההסתעפות ליד אתר החבור של 3'. U5/U4/U6 קושרים אקסונים באתר 5', כאשר U6 נקשר ל-U2. מאוחר יותר, U1 משוחרר. U5 עובר מאקסון לאינטרון, ו-U6 נקשר באתר החבור של 5'. יתר על כן, U4 יוצא גם. U6/U2 מזרז טרנסיפיקציה, מה שהופך את קצה 5' של האינטרון לקשור לנוקלאוטיד A על האינטרון. זה גורם להיווצרות לריאט. בהיווצרות של לריאט, U5 קושר אקסון באתר שחבור 3', ואתר 5' מבוקע. בשלב הסופי של השחבור, U2/U5/U6 נשארים קשורים לריאט, ואתר 3' מבוקע. בנוסף לכך, האקסונים מקושרים באמצעות הידרוליזה של ATP בשלב זה.
מהו Trans Splicing?
חבור טרנס הוא מנגנון בין-מולקולרי שמסיר אינטרונים או אאוטרונים ומצטרף לאקסונים שאינם בתוך אותו תמליל RNA. ב-trans-splicing, אין אתר שחבור של 5' במולקולת הקדם mRNA עבור חלבון U1 להיקשר. במקום זאת, RNA מוביל splice capped (SL) מחולק לרצף בחוץ.
איור 02: Trans Splicing
Outron הוא אזור של ה-mRNA הקדם בין כובע 5' לאתר החבור הטרנס. עם זאת, חלבון U2 נקשר לאתר השבר 3' בדרך כלל. לאחר הסרת האאוטרון, האקסון של מנהיג ה-Splice (SL) חובר לאקסון הראשון ב-Pre-mRNA. יתר על כן, שחבור טרנס הוא מנגנון שנצפה במיקרואורגניזמים מסוימים כגון פרוטיסטים מקבוצת Kinetoplastae כדי לבטא גנים.
מהם הדמיון בין חיבור Cis ו-Trans?
- Cis ו-transsplicing הם שני סוגים של מנגנוני שחבור RNA.
- בשני המנגנונים, אינטרונים מוסרים.
- כמו כן, בשני המנגנונים, אקסונים מחוברים ליצירת mRNA בוגר.
- שני המנגנונים נמצאים באוקריוטים.
- מנגנונים אלה נעדרים בפרוקריוטים.
מה ההבדל בין Cis ו-Trans Splicing?
Cis splicing הוא מנגנון תוך-מולקולרי שמסיר אינטרונים ומחבר את האקסונים שנמצאים בתוך אותו תמליל RNA, בעוד ש-trans-splicing הוא מנגנון בין-מולקולרי שמסיר אינטרונים או אאוטרונים ומחבר את האקסונים שאינם בתוך אותו RNA. תמלול. אז זה ההבדל העיקרי בין חיבור cis ו-trans. יתר על כן, בשחבור cis, אינטרונים מוסרים ליצירת mRNA בוגר. מצד שני, בשחבור טרנס מוסרים אינטרונים או אאוטרונים ליצירת mRNA בוגר.
האינפוגרפיקה הבאה מפרטת את ההבדלים בין חיבור cis ו-trans בצורת טבלה להשוואה זה לצד זה.
סיכום - Cis vs Trans Splicing
שחבור RNA הוא סוג של עיבוד RNA לפני תהליך סינתזת החלבון. חיבור Cis וטרנס הם שני סוגים של מנגנוני שחבור של RNA שנמצאים באוקריוטים. שחבור Cis הוא מנגנון תוך-מולקולרי שמסיר אינטרונים ומחבר את האקסונים שנמצאים בתוך אותו תמליל RNA, בעוד ש-trans-splicing הוא מנגנון בין-מולקולרי שמסיר אינטרונים או אאוטרונים ומצטרף לאקסונים שאינם בתוך אותו תמליל RNA. לפיכך, זה מסיים את הדיון בהבדל בין cis ו-trans splicing.
