siRNA לעומת miRNA
RNA הן מולקולות חשובות מאוד, שעוזרות לבנות את החיים של אורגניזמים. לאחרונה גילו מדענים רנ א קטנים הנקראים הפרעת RNA או RNAi, הפועלים לאחר התמלול לשלוט בביטוי הגנים. שני הסוגים העיקריים של RNAs קטנים הם מיקרו RNA או miRNA ו-RNA מתערב קטן או siRNA. מולקולות אלו בעצם מווסתות את ביטוי הגנים על ידי דיכוי גן המטרה. גם ל-miRNA וגם ל-siRNA יש מסלולי ביוגנזה דומים מאוד, אם כי קיימים כמה הבדלים ביניהם. המקור של miRNA ו-siRNA הם ממולקולות dsRNA. מירנאים בוגרים דומים מבחינה מבנית למולקולות siRNA.
miRNA
מיקרו RNAs או miRNAs הם מולקולות ה-RNA הקטנות שמתווכות את הבדיקה הסופית בוויסות הגנים התרגום. דה-רגולציה של miRNA עשויה להוביל לסרטן ולהתפתחות מחלות אחרות. לכן, הרגולציה הנכונה של מידע המקודד באזור הלא-מקודד של miRNA היא קריטית מאוד בתהליכים תאיים בסיסיים רבים.
siRNA
siRNAs מכונים גם כ-RNA קצר מפריע או משתיק והם מורכבים מ-RNA כפול גדילי עם 20 עד 25 זוגות בסיסים. התפקיד העיקרי של siRNA הוא להפריע לביטוי של גנים ספציפיים עם רצפי נוקלאוטידים משלימים. siRNA מורכב מ-RNA דו-גדילי קצר עם קצוות 5' מזורחנים וקצוות 3' עם הידרוקסילציה עם שני נוקלאוטידים תלויים מעל.
מה ההבדל בין siRNA ל-miRNA?
• miRNA נגזר מלוקוסים גנומיים ספציפיים, בעוד ש-siRNA נגזר מ-mRNA, טרנספוזונים, וירוסים או DNA הטרוכרומטי.
• סינתזה של miRNA מעובדת מתמלילים ארוכים יותר של סיכת ראש (רצף miRNA גרעיני ראשוני על ידי אנדונוקלאז RNase III), ואילו זה של siRNA מעובד מתמלילים ארוכים של RNA דו-מולקולרי.
• כל מולקולת מבשר סיכת ראש של מירנה מייצרת דופלקס של מירנה יחיד, בעוד שכל מולקולת מבשר של siRNA מייצרת מספר דופלקסים של siRNA.
• רצפי siRNA נשמרים לעתים רחוקות, בעוד שרצפי miRNA נשמרים היטב.
• כל הבסיסים בתוך siRNA תורמים לספציפיות היעד שלו, בעוד שרק מחצית ה-miRNA תורמת לספציפיות היעד שלו.
• miRNA נקשרת לעתים קרובות לאזור 3' הלא מתורגם של תעתיקי יעד, בעוד ש-siRNAs יוצרים דופלקס משלים בכל מקום לאורך mRNA מטרה.
• miRNA ציין 'הטרו- השתקה' בעוד ש-siRNA משמש ל'השתקה אוטומטית'.
• miRNA פועלת כאות למניעת תרגום, ואילו siRNA מונעת פיזית תרגום.