הבדל מפתח – מיני-לווין לעומת מיקרו-לווין
DNA חוזר הוא רצפי הנוקלאוטידים שחוזרים על עצמם שוב ושוב בגנום של אורגניזמים. ה-DNA החוזר מהווה חלק ניכר מה-DNA הגנומי, וישנם שלושה סוגים עיקריים הנקראים חזרות טנדם, חזרות סופניות וחזרות משולבות. חזרות טנדם הן הרצפים החוזרים על עצמם מאוד השוכנים זה לצד זה ללא הפרעה. ישנם שלושה סוגים עיקריים של חזרות טנדם בגנום החולייתנים. הם DNA לווייני, DNA מיקרו-לווין ו-DNA מיני-לווייני. מיני-לווין הוא קטע של DNA שחוזר על עצמו מאוד המורכב מסדרה של רצף חוזר המורכב מ-10 עד 100 זוגות בסיסים.מיקרו-לווין הוא קטע של DNA שחוזר על עצמו המורכב מרצפים קצרים שחוזרים על עצמם המורכבים מ-1 עד 9 זוגות בסיסים. לכן, ההבדל העיקרי בין מיני-לוויין למיקרו-לווין הוא הגודל או האורך של הרצף החוזר.
מהו מיני-לוויין?
Minisatellite DNA הוא קטע של DNA הכולל סדרה של רצף קצר של DNA חוזר באורך של 10 עד 60 זוגות בסיסים. מיני לוויינים מכונים גם חזרות טנדם משתנה של מספר משתנה (VNTR). לעתים קרובות מבולבלים מיני-לוויינים עם מיקרו-לוויינים. עם זאת, מיני-לוויינים ומיקרו-לוויינים מובחנים כעת על סמך גודל הרצף החוזר על ידי מדענים.
ניתן לראות מיני-לוויינים ביותר מ-1000 מקומות בגנום האנושי. רצפים קצרים אלה עשירים ב-G ו-C. מספר החזרות במיני-לוויין נתון משתנה מאוד בין הפרטים.
מיני-לווין אנושי ראשון זוהה על ידי A. R. Wyman ו-R. White בשנת 1980. מאוחר יותר, אלק ג'פריס גילה את הפולימורפיזם הקיצוני של מספר ההעתקים של מיני-לוויינים בין אורגניזמים. התגליות הללו הפכו מיני לוויינים כסמנים אידיאליים לטביעת אצבע של DNA, ניתוח קישורים ומחקרי אוכלוסיה. מיני לוויינים תורמים גם לוויסות של ביטוי גנים, שעתוק, שחבור חלופי וכו'.
מהו מיקרו-לווין?
Microsatellite הוא קטע של DNA שיש לו רצף חזרות פשוטות באורך של 1 עד 10 זוג בסיסים. מיקרו-לוויינים נקראים גם חזרות קצרות (SSR) או חזרות טנדם פשוטות (STR). ישנם שני סוגים של מיקרו לוויינים בשם מיקרו לוויינים פשוטים ומיקרו לוויינים מרוכבים. מיקרו-לוויינים פשוטים מורכבים מסוג אחד בלבד של רצפים חוזרים. מיקרו-לוויינים מרוכבים מורכבים מיותר מסוג אחד של חזרות.למיקרו-לוויינים יש לרוב אזורי A/T פולי. מיקרו-לוויינים הם דומיננטיים ושופעים בגנומים אוקריוטיים.
בדומה למיני-לוויינים, גם מיקרו-לוויינים מראים פולימורפיזם בקרב פרטים. מספר החזרות עבור מיקרו-לווין נתון משתנה בין הפרטים. לכן, מיקרו-לוויינים יכולים לשמש גם כסמנים גנטיים בטביעת אצבע של DNA. ניתן לזהות בקלות פולימורפיזם של מיקרו-לווין על ידי PCR ואלקטרופורזה של ג'ל. האזור האגף של מיקרו-לווין שמור מאוד במינים קרובים.
מהם הדמיון בין מיני-לווין למיקרו-לווין?
- מיני-לוויינים ומיקרו-לוויינים הם רצפי DNA שאינם מקודדים.
- שניהם חוזרים בטנדם.
- שניהם מורכבים מרצפים שחוזרים על עצמם מאוד.
- שניהם יכולים לשמש כסמנים גנטיים רבי עוצמה לטביעת אצבע של DNA.
מה ההבדל בין מיני-לווין למיקרו-לווין?
Minisatellite לעומת Microsatellite |
|
| מיני-לוויינים הם חזרות טנדם עם אורך חוזר של מונומר של 10 עד 100 זוגות בסיסים. | Microsatellites הם חזרות טנדם קצרות המורכבות מרצפים חוזרים של 1 עד 9 זוגות בסיסים של מונומרים. |
| גודל הרצף החוזר | |
| Minisatellite כולל רצפים חוזרים של 10 עד 100 זוגות בסיסים. | Microsatellite כולל רצפים קצרים של 1 עד 9 זוגות בסיסים. |
| בסיסים משותפים | |
| מיני-לוויינים עשירים בבסיסי G ו-C. | מיקרו-לוויינים עשירים בבסיסי A ו-T. |
| שמות אחרים | |
| מיני לווין ידועים גם כחזרות טנדם של מספר משתנה (VNTR). | Microsatellites ידועים גם כחזרות רצף קצרות (SSR) או חזרות טנדם פשוטות (STR). |
סיכום – מיני-לווין לעומת מיקרו-לווין
מיני-לווין ומיקרו-לווין הם שני סוגים של חזרות טנדם. הם מובחנים על סמך מספר הבסיסים ברצף החוזר או גודל הרצף. למיני-לווין יש רצף חוזר באורך של 10 עד 100 זוגות בסיסים, בעוד שלמיקרו-לווין יש רצף חוזר באורך של 1 עד 9 זוגות בסיסים. זה ההבדל העיקרי בין מיני-לווין למיקרו-לווין. מספר ההעתקים של רצף חוזר במיני-לוויינים ומיקרו-לוויינים משתנה מאוד בין אנשים. גם מיני-לוויינים וגם מיקרו-לוויינים הם סמני DNA רבי עוצמה לניתוח שונות גנטית בתוך ובין אוכלוסיות של מינים.
הורד את גרסת ה-PDF של Minisatellite לעומת Microsatellite
ניתן להוריד את גרסת ה-PDF של מאמר זה ולהשתמש בה למטרות לא מקוונות לפי הערות ציטוט. אנא הורד כאן גרסת PDF ההבדל בין מיני-לווין למיקרו-לווין.
