ההבדל העיקרי בין NAAT ל-PCR הוא ש-NAAT הוא שיטה שמגבירה חומר גנטי באמצעות מספר דרכים, כולל תגובת שרשרת פולימראז, עקירת גדילים או הגברה בתיווך שעתוק, בעוד ש-PCR היא שיטה המגבירה חומר גנטי רק באמצעות רכיבה תרמית.
פתוגנים מזוהים בעיקר על ידי הגברה של החומר הגנטי שלהם. רוב הטכניקות בתחום זה מתמקדות בזיהוי החומר הגנטי של הפתוגן על ידי הגברה של רצפים ספציפיים בזמן אמת. לכן, התוצאות מופקות מהר מאוד בהקשר האבחוני. NAAT, PCR, biosensor ו-LCR הן מספר טכניקות המשמשות במעבדות להגברת החומר הגנטי של הפתוגן.
מה זה NAAT?
מבחן הגברה של חומצת גרעין (NAAT) היא שיטה בביולוגיה מולקולרית המגבירה חומר גנטי באמצעות מספר דרכים כגון תגובת שרשרת פולימראז, הגברה של עקירת גדילים או הגברה בתיווך שעתוק. הגברה של חומר גנטי יכולה להיעשות גם באמצעות טכניקות כמו תגובת שרשרת קשירה ותגובת DNA מסועפת (quantiplex b DNA) בהליך NAAT. NAAT משתמש בספציפיות של זיווג בסיסים ווטסון-קריק. בהליך NAAT, בדיקה חד-גדילית או מולקולת פריימר עוברת הכלאה עם מולקולת ה-DNA או ה-RNA היעד. לכן, העיצוב של גדיל הבדיקה הוא משמעותי ביותר כדי לשפר את הרגישות והספציפיות של הגילוי. לאחר מכן, השלב הבא של ה-NAAT מגביר את החומר הגנטי על ידי יצירת עותקים רבים שלו לזיהוי.
איור 01: NAAT
NAAT מיושם כעת לזיהוי של מספר פתוגנים כגון Neisseria gonorrhea, Chlamydia trachomatis, Mycobacterium tuberculosis ו-SARS-COV2. יתרה מכך, מבחן NAAT פותח כדי לקצר את תקופת החלון. תקופת החלון היא פרק הזמן שבין מועד ההדבקה של מטופל ועד שהוא מופיע כחיובי בבדיקות נוגדנים. יתר על כן, שיטת הסקר NAAT אושרה לראשונה בשנת 1999 על ידי ה-FDA. ל-NAAT יתרונות רבים, כולל זיהוי רמות נמוכות של DNA או RNA, רגישות גבוהה וסגוליות גבוהה.
מה זה PCR?
PCR היא שיטה בביולוגיה מולקולרית המגבירה חומר גנטי באמצעות רכיבה תרמית בלבד. PCR מייצג תגובת שרשרת פולימראז. זוהי בדיקה לאיתור חומר גנטי מאורגניזם ספציפי כגון חיידקים, פטריות ווירוסים. באבחון מחלה, PCR מזהה נוכחות של פתוגן אם לאדם יש פתוגן בזמן הבדיקה.באבחון מחלה, לפרוטוקול PCR יש מספר שלבים, כולל איסוף דגימות, מיצוי DNA, PCR ורצף. בבדיקת פתוגנים, הדגימה שנאספה משמשת למיצוי חומר גנטי (DNA או RNA). הליך PCR דורש כימיקלים מיוחדים, פריימרים ואנזימים על מנת לייצר מיליוני עותקים של חומר גנטי בתוך מכונת ה-PCR הנקראת מחזור תרמי. לאחר הגברה ממוצר ה-PCR, ניתן לזהות את הפתוגן. מדענים משתמשים בתוכנה מיוחדת כדי לפרש את התוצאות.
איור 02: PCR
יתר על כן, ישנם סוגים שונים של PCR המשמשים כיום במחקר. RT-PCR, Multiplex PCR, RAPD ו- Nested PCR הם כמה ביניהם. PCR שימושי במיוחד בזיהוי של דלקת הלוע (Streptococcl pharyngitis), דלקת ריאות לא טיפוסית (Chlymydia pneumoniae), חצבת (Morbillivirus), הפטיטיס (HBV) וזיהום אורוגניטלי כיבי (Haemophilus ducreyi).
מהם הדמיון בין NAAT ל-PCR?
- NAAT ו-PCR הן שתי שיטות ביולוגיות מולקולריות חשובות המשמשות להגברת חומר גנטי.
- חומצות גרעין (DNA או RNA) מוגברות בשתי הטכניקות.
- הם טכניקות מהירות ומהירות.
- שתי הטכניקות משמשות כיום לאבחון מחלה.
- הם יקרים משיטות קונבנציונליות.
מה ההבדל בין NAAT ל-PCR?
NAAT היא שיטה בביולוגיה מולקולרית המגבירה חומר גנטי במספר שיטות, בעוד ש-PCR היא שיטה בביולוגיה מולקולרית המגבירה חומר גנטי באמצעות מחזוריות תרמית בלבד. NAAT משתמש בטכניקות שונות של הגברה של חומר גנטי כגון תגובת שרשרת פולימראז, הגברה של עקירת גדילים, הגברה בתיווך שעתוק, תגובת שרשרת קשירה ותגובת DNA מסועפת (quantiplex b DNA).מצד שני, PCR משתמש בטכניקות שונות של הגברה של חומרים גנטיים כמו RT-PCR. Multiplex PCR, RAPD, Nested PCR. אז זה ההבדל העיקרי בין NAAT ל-PCR.
האינפוגרפיקה שלהלן מציגה את ההבדלים בין NAAT ו-PCR בצורה טבלה להשוואה זו לצד זו.
סיכום – NAAT לעומת PCR
ישנם כלים ביולוגיים מולקולריים שונים המשמשים במעבדות להגברת חומרים גנטיים. NAAT, PCR, biosensor ו- LCR הן מספר טכניקות כאלה. NAAT היא טכניקה ביולוגית מולקולרית המגבירה חומר גנטי באמצעות מספר דרכים כגון תגובת שרשרת פולימראז, עקירת גדילים או הגברה בתיווך שעתוק. PCR היא שיטה בביולוגיה מולקולרית המגבירה חומר גנטי באמצעות מחזוריות תרמית. לפיכך, זהו ההבדל העיקרי בין NAAT ל-PCR.
