ההבדל העיקרי בין קסילן ציאנול לברומופנול כחול הוא שבג'ל אגרוז 1%, קסילן ציאנול נודד לאט יותר, בעוד שברומופנול כחול נודד מהר יותר.
קסילן ציאנול וכחול ברומופנול חשובים כסמני צבע שיכולים לשמש בניטור תהליך של אלקטרופורזה של ג'ל אגרוז ואלקטרופורזה של ג'ל פוליאקרילאמיד.
מהו Xylene Cyanol?
Xylene cyanol הוא סמן צבע אלקטרופורטי או צבע מעקב. זה שימושי בניטור תהליך של אלקטרופורזה של ג'ל אגרוז ואלקטרופורזה של ג'ל פוליאקרילאמיד. כאשר חומר זה מעורבב עם הדגימה, ריכוז החומר הזה הופך בדרך כלל ל-0 בערך.005% עד 0.03%. כמה מילים נרדפות שנוכל להשתמש בהן עבור קסילן ציאנול כוללות Acid Blue 147, xylene cyanole, xylene cyanol FF, xylene cyanol FF וכו'.
הנוסחה הכימית של תרכובת זו היא C25H27N2NaO 6S2 המסה המולרית של קסילן ציאנול היא 538.61 גרם/מול. חומר זה יכול לנדוד בקצב של כ-4 - 5 שברי DNA של זוג קילו-בסיסים בג'לים של 1% אגרוז. עם זאת, זה תלוי במאגר שבו אנו משתמשים. בדרך כלל, קסילן ציאנול על ג'ל פוליאקרילאמיד 6% יכול לנדוד במהירות של כ-140 שברי DNA של זוגות בסיסים. מצד שני, הוא יכול לנדוד באלקטרופורזה של ג'ל פוליאקרילאמיד דנטור 20% בקצב של אוליגונוקלאוטיד של 25 בסיסים.
ספירת תורמי קשרי המימן של קסילן ציאנול היא 2 מטר, וספירת מקבלי קשרי המימן היא 8. ניתן לתת את ספירת הקשרים הניתנים לסיבוב של תרכובת זו כ-7. ניתן לתאר את המורכבות של קסילן ציאנול כ-1120 מעלות. יש לו ספירת סטריאומרכז קשר מוגדרת של 1.
מהו ברומופנול כחול?
Bromophenol blue הוא מחוון pH שימושי ששימושי כסמן צבע אלקטרופורטי וכצבע. יש לו את השם הכימי 3', 3", 5', 5"-tetrabromophenolsulfonphthalein, BPB. הנוסחה הכימית של תרכובת זו היא C19H10Br4O5 S. המסה המולרית של תרכובת זו היא 669.96 גרם/מול. הוא חסר ריח, וצפיפותו יכולה להיות 2.2 גרם/מ"ל. נקודת ההיתוך שלו היא 273 מעלות צלזיוס, ונקודת הרתיחה שלו היא 279 מעלות צלזיוס. נוכל להכין אותו על ידי הוספת עודפי ברום לאט לתמיסה חמה של פנולסולפונפטלין בחומצה קרחונית.
Bromophenol blue שימושי כמחוון חומצה-בסיס בטווח שבין pH 3.0 ל-4.6. הוא מסוגל לעבור מצהוב ב-pH 3.0 ל-pH 4.6. יתר על כן, זוהי תגובה הפיכה. מבחינה מבנית, ברומופנול כחול דומה לפנולפטלין.
חוץ מזה, אנחנו יכולים להשתמש בו כסמן צבע כדי לפקח על תהליך האלקטרופורזה של ג'ל אגרוז ושל אלקטרופורזה של ג'ל פוליאקרילאמיד. חומר זה יכול לשאת מטען שלילי ב-pH בינוני, שם הוא יכול לנדוד באותו כיוון כמו DNA או חלבון בג'ל. קצב הנדידה יכול להשתנות בהתאם לצפיפות הג'ל והרכב החיץ. עם זאת, בג'ל אגרוז טיפוסי של 1% במאגר TAE חד פעמי או במאגר TBE, חומר זה נודד באותו קצב כמו שבר DNA של כ-300 זוגות בסיסים.
מה ההבדל בין קסילן ציאנול לברומופנול כחול?
Xylene cyanol וכחול bromophenol הם סמני צבע חשובים. ההבדל העיקרי בין קסילן ציאנול לברומופנול כחול הוא שבג'ל אגרוז 1%, קסילן ציאנול נודד לאט יותר, בעוד שברומופנול כחול נודד מהר יותר.
להלן סיכום ההבדל בין קסילן ציאנול לברומופנול כחול בצורת טבלה להשוואה זו לצד זו.
סיכום – Xylene Cyanol נגד Bromophenol Blue
Xylene cyanol ו-bromophenol blue חשובים כסמני צבע המשמשים בניטור תהליך של אלקטרופורזה של ג'ל אגרוז ואלקטרופורזה של ג'ל פוליאקרילאמיד. ההבדל העיקרי בין קסילן ציאנול לברומופנול כחול הוא שבג'ל אגרוז 1%, קסילן ציאנול נודד לאט יותר ואילו ברומופנול כחול נודד מהר יותר.
