ההבדל העיקרי בין בדיקת LAMP ל-PCR הוא ש-LAMP מתבצע בטמפרטורה קבועה (60-650C) כדי לייצר עותקים של DNA באמצעות הגברה, בעוד ש-PCR מתבצע שימוש בסדרה של שינויי טמפרטורה כדי לייצר עותקים של DNA באמצעות הגברה.
LAMP ו-PCR הן שתיהן טכניקות הגברה במבחנה המשמשות לייצור אלפי עותקים של DNA. כמות ה-DNA המיוצר ב-LAMP גבוהה בהרבה מהכמות המיוצרת בטכניקות PCR כגון RT-PCR. LAMP היא טכניקה חדשה יותר בהשוואה לטכניקת PCR. אבל זה פשוט טכנית וקל עבור מדען מיומן לבצע בתנאי מעבדה.זה הופך אותה לטכניקה שימושית פוטנציאלית לזיהוי COVID-19. עם זאת, RT-PCR הוא המבחן הסטנדרטי הנוכחי עבור COVID-19. טכניקות אלו, למרות שהן מוכרות היטב לחוקרים ולרופאים עם רקע בהגברת DNA, עדיין עשויות להיות בלתי ידועות יחסית לקהילה רחבה יותר.
מהו מבחן LAMP?
הגברה איזותרמית בתיווך לולאה (LAMP) עבור מבחני COVID-19 מתחילים באיסוף דגימות מהאף או מהגרון באמצעות ספוגית. ניתן לאסוף את הדגימות גם בשיטות אחרות כמו ריר משיעול קשה. כמו טכניקת PCR כגון RT-PCR, ה-RNA הנגיפי בדגימה הופך תחילה ל-DNA, מה שמאפשר להעתיק אותו. תגובת LAMP מתבצעת בטמפרטורה קבועה (60-650C).
ניתן לזהות את ההגברה של DNA ויראלי המשלב טכנולוגיית LAMP וריאגנטים כאשר תערובת התגובה הופכת עכורה עקב ייצור "מגנזיום pyrophosphate".עכירות זו מאפשרת אבחנה קלה של COVID-19 על ידי מדענים ורופאים. ניתן לשפר את הדיוק של תוצאות הבדיקה על ידי שימוש בצבעים ניאון מיוחדים או בצבעים משנים צבע בתערובת התגובה. צבעים אלה מקיימים אינטראקציה עם DNA ויראלי, וניתן למדוד את עוצמת האור או השינוי בצבע כדי לתת את מספר מולקולות ה-RNA הנגיפי בערך שהיה בתחילה בדגימה.
מהו מבחן PCR?
PCR היא טכניקה מדעית נפוצה מאוד שנמצאת בשימוש נרחב במחקר וברפואה במשך 20-30 שנה לאיתור DNA. בדיקות PCR משמשות ישירות לאיתור אנטיגן על ידי זיהוי RNA ויראלי. בדרך כלל, RNA ויראלי קיים בגוף לפני גילוי נוגדנים או קבלת תסמיני המחלה. לכן, בדיקת PCR יכולה לדעת אם למישהו יש את הנגיף בשלב מוקדם או לא. נכון לעכשיו, PCR הוא המבחן הסטנדרטי לגילוי COVID-19. ישנם סוגים שונים של טכניקות PCR כגון PCR בזמן אמת, PCR מקונן, PCR מרובי, PCR הפעלה חמה ו-PCR לטווח ארוך וכו'. PCR משתמש בסדרה של שינויי טמפרטורה כדי לייצר עותקים של DNA באמצעות הגברה.
RT-PCR היא גרסה מיוחדת של טכניקת PCR. הוא משמש כאשר RNA מתגלה. הוא משמש כעת לבדיקת COVID-19. RT-PCR היא טכניקה די רגישה ואמינה. ב-RT-PCR, לאחר איסוף דגימה, נעשה שימוש בכימיקלים להסרת חלבונים, שומנים ומולקולות לא רצויות, תוך השארת ה-RNA מאחור. אנזימי ערכת הבדיקה ממירים תחילה RNA ל-DNA, אשר לאחר מכן מגביר DNA ויראלי על מנת לזהות את הנגיף. צבעי פלורסנט משמשים בדרך כלל כדי להיקשר ל-DNA המוגבר ולהפיק אור. ניתן לקרוא את זה על ידי המכונה כדי להפיק את תוצאת הבדיקה.
מהם הדמיון בין בדיקת LAMP ל-PCR?
- זהו טכניקות הגברה.
- שניהם מייצרים DNA מועתק.
- הן טכניקות מאוד רגישות ואמינות מאשר טכניקה חיסונית כמו זיהוי נוגדנים.
- שניהם משמשים לבדיקות COVID-19.
מה ההבדל בין בדיקת LAMP ל-PCR?
ההבדל העיקרי בין בדיקות LAMP ל-PCR הוא שב-LAMP, הגברה מושגת באמצעות טמפרטורה קבועה (60-650C), בעוד שב-PCR, מחזור של נדרשות טמפרטורות. מספר סוגים של טכניקות LAMP זמינות כעת. אבל החשובים ביותר לזיהוי COVID-19 הם טכניקה איזותרמית (RT-LAMP) מתווכת בלולאה הפוכה והגברה בתיווך תמלול (TMA). יתרה מזאת, סוגים שונים של טכניקות PCR זמינות כיום גם בפרקטיקה הקלינית לאבחון מחלות, כגון PCR בזמן אמת, RT-PCR, PCR מקונן, PCR מרובי, PCR עם התחלה חמה, PCR ארוך טווח וכו'.
האינפוגרפיקה שלהלן מפרטת את ההבדלים בין בדיקת LAMP ל-PCR בצורת טבלה.
סיכום – בדיקת LAMP לעומת PCR
הגברה איזותרמית בתיווך לולאה הוא תהליך דומה לבדיקות PCR כגון RT-PCR, אך הוא מייצר יותר עותקי DNA ויראליים בטמפרטורה קבועה. בדיקת תגובת שרשרת פולימראז היא כיום צורת הבדיקה הנפוצה והסטנדרטית ביותר בעולם לאבחון מחלות, כגון אבחון COVID-19. זה נתפס כאמין למדי. PCR משתמש בסדרה של שינויי טמפרטורה כדי לייצר עותקים של DNA באמצעות הגברה. לפיכך, זה מסכם את ההבדל בין בדיקת LAMP ל-PCR.
