ההבדל העיקרי בין איזו-שכיזומרים לניאו-שכיזומרים הוא שאיזו-שכיזומרים הם אנזימי הגבלה בעלי אותו רצף זיהוי ומבקעים את ה-DNA באותן מיקומים, בעוד שניאו-שכיזומרים הם אנזימי הגבלה בעלי אותו רצף זיהוי אך מבקעים DNA במיקומים שונים..
אנזימים של הגבלה או אנדונוקלאזים של הגבלה הם אנזימים שמבקעים DNA למקטעים באתרי זיהוי ספציפיים או בסמוך להם. הם חותכים DNA באתרי הגבלה. אנזימי הגבלה מסווגים בדרך כלל לחמש קבוצות על סמך מבנה, בין אם הם חותכים את מצע ה-DNA שלהם באתר הזיהוי שלהם, ובין אם אתרי הזיהוי והביקוע נפרדים זה מזה.יותר מ-3600 אנדונוקליזות הגבלה כבר זוהו. כ-800 אנזימי הגבלה זמינים מסחרית. איזוסכיזומרים וניאו-סכיזומרים הם שני סוגים של אנזימי הגבלה המבוססים על אתר זיהוי וסגוליות המחשוף.
מהם איזוסכיזומרים?
איזוסכיזומרים הם אנזימי הגבלה בעלי אותו רצף זיהוי ומבקעים את ה-DNA באותם מיקומים. לאנזימי הגבלה אלה יש את אותה סגוליות. אנזים ההגבלה שהתגלה הראשון שמזהה רצף נתון ידוע כאב טיפוס, בעוד שכל אנזימי ההגבלה שזוהו לאחר מכן המזהים את אותו רצף נקראים איזושכיזומרים. עם זאת, איזושכיזומרים עשויים להיות שונים בהעדפות האתר, תנאי התגובה, רגישות המתילציה ופעילות הכוכבים. איזוסקיזומרים מבודדים מזנים שונים של חיידקים. לכן, הם עשויים לדרוש תנאי תגובה שונים. במקרים מסוימים, רק אחד מתוך זוג איזושכיזומרים יכול לזהות צורות מתיל ובלתי מתיל של אתרי הגבלה כאחד.מצד שני, אנזים ההגבלה האחר יכול לזהות רק את הצורה הלא-מתילית של אתר ההגבלה. תכונה מסוימת זו של איזוסכיזומרים מסייעת בזיהוי מצב המתילציה של אתר ההגבלה תוך בידוד ממצב חיידקי.
לדוגמה, AgeI ו-BshT1 מזהים ומחלקים 5'-A↓CCGGT באותה תבנית. HpaII ו-MSPI הם זוגות אחרים של איזושכיזומרים. שניהם מזהים את רצף 5'-C↓CGG-3' כאשר הוא לא מתיל. אבל כאשר ה-C השני של הרצף עובר מתיל, רק MSPI יכול לזהות את הרצף הזה בעוד ש-HpaII לא יכול לזהות אותו.
מהם ניאו-שכיזומרים?
ניאו-שכיזומרים הם אנזימי הגבלה בעלי אותו רצף זיהוי אך מבקעים DNA במיקומים שונים. בכמה יישומים ביולוגיים מולקולריים מיוחדים, זוהי תכונה מועילה מאוד. הניאו-שכיזומרים הם תת-קבוצה של איזושכיזומרים. דוגמאות ידועות לנאו-סכיזומרים הן SmaI (5'-CCC↓GGG-3') ו-XmaI (5'-C↓CCGGG-3'); שניהם מזהים את רצף 5'-CCCGGG-3' אך מבקעים אותם במיקום אחר.לפיכך, שני אנזימי ההגבלה הללו מייצרים סוגים שונים של קצוות. במקרה זה, SmaI מייצר קצוות קהים, ו-XmaI מייצר קצוות בולטים של 5'.
איור 01: Neoschizomers
דוגמה נוספת היא צמד אנזימים להגבלה של MaeII ו-Tail. אב-טיפוס MaeII (A↓CGT) מייצר שברי DNA עם סיומת של 2-בסיסים 5', וזנב ניאו-שכיזומר (ACGT↓) מייצר שברי DNA עם סיומת של 4-base3'.
מהם הדמיון בין איזוסכיזומרים לנאו-שכיזומרים?
- איזוסכיזומרים וניאו-סכיזומרים הם שני סוגים של אנזימי הגבלה.
- הם נמצאים בעיקר בפרוקריוטים.
- הם חלק ממערכת ההגבלה-שינוי (RM) שנמצאת בחיידקים וארכיאה.
- שתיהן מולקולות חלבון.
- שניהם מבקעים DNA לשברים.
מה ההבדל בין איזוסכיזומרים לנאו-שכיזומרים?
איזוסכיזומרים הם אנזימי הגבלה בעלי אותו רצף זיהוי ומבקעים את ה-DNA באותן מיקומים, בעוד שניאו-סכיזומרים הם אנזימי הגבלה בעלי אותו רצף זיהוי אך מבקעים את ה-DNA במיקומים שונים. אז זה ההבדל העיקרי בין איזושכיזומרים לנאו-שכיזומרים. יתר על כן, לאיזוסכיזומרים יש את אותם סגולות בעוד שלניוסכיזומרים יש סגוליות שונות.
האינפוגרפיקה הבאה מפרטת את ההבדלים בין איזוסכיזומרים וניאו-שכיזומרים בצורת טבלה להשוואה זה לצד זה.
סיכום – Isoschizomers לעומת Neoschizomers
אנזימים של הגבלה הם אנזימים לחיתוך DNA. הם נקראים גם מספריים מולקולריים. ישנם סוגים שונים של אנזימי הגבלה.בהתבסס על אתר הזיהוי והספציפיות של המחשוף, אנזימי הגבלה הם שני סוגים כמו איזושכיזומרים וניאושכיזומרים. לאיזוסכיזומרים יש את אותו רצף זיהוי והם מבקעים את ה-DNA באותן מיקומים בעוד שלניאו-שכיזומרים יש אותו רצף זיהוי אך מבקעים DNA במיקומים שונים. לפיכך, זהו ההבדל העיקרי בין איזוסכיזומרים לניאו-שכיזומרים.
