ההבדל העיקרי בין אנזימי הגבלה EcoRI ו-HindIII הוא ש-EcoRI הוא אנזים הגבלה מסוג II המבודד מ-E. coli, בעוד HindIII הוא אנזים הגבלה מסוג II המבודד משפעת Haemophilus.
אנזים הגבלה או אנדונוקלאז של הגבלה הוא אנזים שמבקע DNA למקטעים באתרי זיהוי ספציפיים (אתרי הגבלה) בתוך מולקולת ה-DNA. אנזימי הגבלה אלו נמצאים בחיידקים ובארכאים. הם מספקים מנגנון הגנה מפני וירוסים פולשים. אנזימי הגבלה מסווגים בדרך כלל לחמישה סוגים שונים: סוג I, סוג II, סוג III, IV וסוג V. EcoRI ו-HindIII הם שני אנזימי הגבלה השייכים לקבוצת אנזימי ההגבלה מסוג II.
מהם אנזימי הגבלה של EcoRI?
EcoRI הוא אנזים הגבלה מסוג II המבודד ממינים מסוג E.coli. זהו אנזים הגבלה שמבקע סליל כפול של DNA לשברים באתרים ספציפיים. EcoRI הוא גם חלק ממערכת הגבלות-שינוי. EcoRI היה האנזים הראשון שבודד במקור מזן RY13 ממין E. coli. הוא משמש כאנזים הגבלה בביולוגיה מולקולרית. EcoRI יוצר 4 קצוות דביקים של נוקלאוטידים עם קצה קצה של 5' של AATT. EcoRI חותך את ה-DNA ברצף הזיהוי הספציפי G↓AATTC. יש לו רצף משלים פלינדרום של CTTAA↓G. יתרה מכך, אנזים הגבלה זה שייך לתת-המעמד מסוג II P (ספציפיות פלינדרוםית). במבנה העיקרי שלו, EcoRI מכיל את מוטיב PD. D/EXK בתוך האתר הפעיל שלו, כמו אנזימי הגבלה רבים אחרים.
איור 01: EcoRI
אנזים ההגבלה EcoRI הוא הומודימר של 31 kDa. הוא מכיל תחום כדורי אחד של ארכיטקטורת α/β. כל תת-יחידה מכילה לולאה הבולטת מהתחום הכדורי ועוטפת את ה-DNA כשהוא קשור. אנזים זה יכול להתגבש יחד עם הרצף שהוא בדרך כלל חותך. יתר על כן, אנזים ההגבלה EcoRI משמש במגוון רחב של טכניקות גנטיות מולקולריות, כולל שיבוט, סקר DNA ומקטעי מחיקה של תנאי DNA במבחנה.
מהם אנזימי הגבלה של HindIII?
HindIII הוא אנזים הגבלה מסוג II המבודד ממיני Haemophilus influenza. הוא מבקע את הרצף הפלינדרומי של ה-DNA AACCTT בנוכחות הקופקטור Mg2+ באמצעות הידרוליזה.הביקוע של הרצף המסוים הזה בין ה-AA'S (5'A↓ACCTT3' ו-3'TTCGA↓A5') גורם לתלייה של 5' על מולקולת ה-DNA הנקראת קצוות דביקים. אנזים זה נמצא באורגניזמים פרוקריוטים כמו חיידקים. חיידקים משתמשים באנזים זה כמנגנון הגנה מפני וירוסים כגון בקטריופאג'ים.
איור 02: HindIII
מבחינה מבנית, HindIII הוא הומודימר. הוא מכיל ליבה מבנית משותפת הכוללת ארבעה גליונות β וסלילי α בודדים, כמו סוגים אחרים של אנזימי הגבלה II. המסה המולקולרית של אנזים זה היא 34.9 kDa. יתר על כן, HindIII שימושי מאוד בניסויים מודרניים של מדע ביולוגי מולקולרי כגון רצף ומיפוי DNA.
מהם הדמיון בין אנזימי הגבלה של EcoRI ו-HindIII?
- EcoRI ו-HindIII הם שני אנזימי הגבלה השייכים לקבוצת אנזימי ההגבלה מסוג II.
- EcoRI ו-HindIII נמצאו בתחילת שנות ה-70.
- EcoRI ו-HindIII שניהם מכילים את מוטיב רצף חומצות האמינו PD.. D/EXK.
- שני אנזימי ההגבלה מבצעים ביקוע מאוד ספציפי של ה-DNA.
- אנזימים הגבלה אלה זקוקים ל-Mg2+ כקו-פקטור לפעילות הספציפית שלהם.
- הם מייצרים קצוות דביקים לאחר חיתוך DNA.
- הם רכיבים שימושיים מאוד במחקר ביולוגי מולקולרי מודרני.
מה ההבדל בין אנזימי הגבלה של EcoRI ו-HindIII?
EcoRI הוא אנזים הגבלה מסוג II המבודד ממינים מסוג E.coli, בעוד HindIII הוא אנזים הגבלה מסוג II המבודד ממיני Haemophilus influenza. לפיכך, זהו ההבדל העיקרי בין EcoRI לבין HindIII.יתר על כן, EcoRI חותך את ה-DNA ברצף הזיהוי הספציפי G↓AATTC, בעוד HindIII חותך את ה-DNA ברצף הזיהוי הספציפי A↓ACCTT.
האינפוגרפיקה שלהלן מציגה את ההבדלים בין EcoRI ו-HindIII בצורת טבלה להשוואה זו לצד זו.
סיכום – EcoRI vs HindIII Restriction Enzymes
EcoRI ו-HindIII הם שני אנזימי הגבלה השייכים לתת-המעמד מסוג II p. הם מבצעים ביקוע מאוד ספציפי של ה-DNA. EcoRI הוא אנזים הגבלה מסוג II המבודד ממינים מסוג E.coli, בעוד HindIII הוא אנזים הגבלה מסוג II המבודד ממינים מסוג Haemophilus influenza. אז זה מסכם את ההבדל בין EcoRI ל-HindIII.
