ההבדל העיקרי בין T4 DNA ligase ל-E. coli DNA ligase הוא ש-T4 DNA ligase הוא אנזים מבודד מבקטריופאג T4 בעוד E. coli DNA ligase הוא אנזים מבודד מהחיידק E. coli.
DNA ligase הוא סוג ספציפי של אנזים המאפשר את החיבור של גדילי DNA יחד באמצעות יצירת קשר פוספודיסטר. הוא ממלא תפקיד חשוב על ידי תיקון שבירות חד-גדילים ושברים כפולים ב-DNA של אורגניזמים חיים. יתר על כן, ליגאז DNA משמש גם בתיקון DNA וגם בשכפול DNA. מלבד השימושים הנ ל, ל-DNA ליגאז יש שימוש נרחב גם בניסויים בביולוגיה מולקולרית כמו טכנולוגיית DNA רקומביננטי. T4 DNA ligase ו-E. coli DNA ligase הם שני סוגים של אנזימי DNA ligase.
מהו T4 DNA Ligase?
T4 ligase הוא אנזים מצטרף DNA המבודד מבקטריופאג T4. בקטריופאג T4 הוא וירוס שמדביק את Escherichia coli. אנזים T4 ליגאז הוא ה-DNA ליגאז הנפוץ ביותר במחקר מעבדה ביולוגית מולקולרית. בדרך כלל, ליגאז T4 מזרז את ההצטרפות של שני גדילים מלוכדים או קהים של DNA דו-גדילי בין קבוצות הפוספט 5' ו-3' ההידרוקסיל של נוקלאוטידים סמוכים. זה יכול גם לזרז את ההצטרפות של RNA לגדיל DNA או RNA במולקולה דופלקסית. עם זאת, אנזים זה לא יצטרף לחומצות גרעין חד-גדיליות. יתר על כן, הוא יכול גם לקשור DNA בעל קצה קהה ביעילות הרבה יותר מאשר ליגז E. coli DNA.
איור 01: T4 DNA Ligase
אנזים זה דורש ATP כקו-פקטור. כמה ניסויים מחקריים של הנדסה גנטית כבר יצרו יותר אנזימים פעילים של דנ א ליגאז מאשר ליגאז DNA מסוג T4 פראי. באחת הגישות, הם יצרו מולקולת אנזים היתוך על ידי סירוק T4 DNA ligase למולקולת p50 או NF-kB. אנזים T4 ליגאז חדש זה היה פעיל ב-160% יותר בקשירות קהות למטרות שיבוט מאשר ליגאז DNA מסוג T4 פראי. יתר על כן, הטמפרטורה האופטימלית עבור ליגאז T4 DNA כדי לזרז את תגובת הקשירה בצורה מדויקת יותר היא 16 מעלות צלזיוס.
מהו E Coli DNA Ligase?
E. coli DNA ligase הוא אנזים המבודד מחיידקי E. coli. הגן האחראי על יצירת E. coli DNA ligase הוא lig gene. ה-DNA E. coli, ligase כמו גם ליגזות ה-DNA הפרוקריוטיות, משתמשות באנרגיה שנרכשת על ידי NAD (nicotinamide adenine dinucleotide) כדי ליצור את הקשר הפוספודיסטר.
איור 02: E. Coli DNA Ligase
E. coli DNA ligase הוא אנזים קשירה שיכול להצטרף לשברי DNA על ידי זרז היווצרות של קשרי פוספודיסטר בין שברי DNA דו-גדילי המכילים 5' פוספט טרמיני ו-3' termini הידרוקסיל. יתר על כן, הוא אינו קושר DNA בעל קצה קהה, אלא בתנאים מיוחדים כגון צפיפות מולקולרית עם פוליאתילן גליקול. זה גם לא יכול לחבר RNA ל-DNA ביעילות. יתר על כן, ניתן להגביר את הפעילות של E. coli DNA ligase על ידי נוכחות של DNA פולימראז 1 בריכוז הנכון. עם זאת, כאשר הריכוז של אנזים DNA פולימראז 1 גבוה יותר, יש לו השפעות שליליות על פעילות E. coli DNA ligase.
מהם הדמיון בין T4 DNA Ligase ל-E Coli DNA Ligase?
- T4 DNA ligase ו-E-coli DNA ligase הם שני סוגים של אנזימי DNA ligase.
- שניהם חלבונים המורכבים מחומצות אמינו.
- האנזימים האלה מזרזים את היווצרותו של קשר פוספודיסטר בין פוספט 5' פוספט לצד 3' טרמיני הידרוקסיל ב-DNA דופלקס.
- יש להם שימושים נרחבים בניסויים בביולוגיה מולקולרית כמו טכנולוגיית DNA רקומביננטי.
מה ההבדל בין T4 DNA Ligase ל-E Coli DNA Ligase?
T4 DNA ligase הוא אנזים מבודד מבקטריופאג T4 בעוד E. coli DNA ligase הוא אנזים מבודד מחיידקי E. coli. לפיכך, זהו ההבדל העיקרי בין ליגאז T4 DNA לליגאז E. coli DNA. יתר על כן, מקור האנרגיה עבור T4 DNA ligase הוא ATP. מצד שני, מקור האנרגיה לליגאז ה-DNA של E. coli הוא NAD.
האינפוגרפיקה שלהלן מציגה את ההבדלים בין T4 DNA ligase ל-E coli DNA ligase בצורה טבלאית להשוואה זו לצד זו.
סיכום – T4 DNA Ligase לעומת E Coli DNA Ligase
T4 DNA ligase ו-E. coli DNA ligase הם שני אנזימים המזרזים היווצרות של קשר פוספודיסטר בין פוספט 5' פוספט ו-3' הידרוקסיל טרמיני דופלקס. T4 ligase הוא אנזים מבודד מבקטריופאג T4 בעוד E. coli DNA ligase הוא אנזים מבודד מחיידק E. coli. אז זה ההבדל העיקרי בין T4 DNA ligase ל-E coli DNA ligase.
